柯南漫画最新主线。。从红与黑的碰撞之后。。谁能告诉偶

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小五郎在与播音员水无怜奈的对话中得知她被恶作剧的门铃所困扰一事，便与柯南及兰一同前往怜奈的家。 小五郎等人虽然抓到了犯人，但此时，柯南却从安装的窃听器中觉察到怜奈实际是黑衣组织同党一事。 随后，黑衣组织制定了于下午1点在艾迪P暗杀一个代号为DJ的人的计划。遭到FBI与柯南的阻止，水无怜奈受伤，昏迷不醒。
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本堂瑛祐登场。
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贝尔摩德去水无怜奈出事目击者家，得到柯南注意；小兰的新同班同学本堂瑛祐在到毛利侦探事务所做客时有意无意的把话题引向水无怜奈，并希望柯南等人前去调查，引起了柯南的警觉。目击水无怜奈出事的小孩被疑似贝尔摩德不明女人询问，并出现了贝尔摩德的口头禅。
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柯南和灰原哀进行调查，得到一张本堂瑛祐父亲的照片，本堂瑛祐及水无怜奈的身份越来越清晰了。

491-504
本堂瑛祐总给柯南不好的感觉，他四处寻找自己的姐姐本堂瑛海，本堂瑛海与水无怜奈长相一摸一样，但是血型不对。与此同时，黑衣组织四处寻找水无怜奈，得到FBI帮助的水无怜奈假装昏迷不醒，被本堂瑛祐袭击后不得不说出真实身份，原来水无怜奈为CIA的卧底和瑛祐的姐姐，水无怜奈答应赤井秀一重新返回组织，但是接到的第一个任务就是杀死赤井秀一，之后赤井秀一疑似牺牲。
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本堂瑛祐知道柯南身份，打算离开日本，柯南对赤井秀一已死的举动奇怪。
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水无怜奈向茱蒂透漏情报，组织派出了一个厉害的侦探波本。
工藤新一的房子里搬来新房客，名为冲矢昴。据灰原哀反应来看此人来头不小，他到底是组织的卧底波本还是重生的赤井秀一？
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柯南发现冲矢昴的推理能力很强，而且是左撇子，爱喝波本酒。
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工藤新一第三次恢复。

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灰原哀再次感到冲矢昴的压迫感。

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脸上带着烧伤的伤疤、疑似赤井秀一的人出现。右眼有着明显的被火烧伤的伤疤。在最后此人捡起了抢劫犯的手枪，在柯南被抢劫犯劫持的紧张时刻，开枪救了柯南。
赤井秀一很喜欢喝波本酒。
578-581
疑似赤井秀一的人再度出现，同时，在商场的茱蒂老师收到了“这里很危险，快逃”的字条，此时冲矢昴也在商场，首次见到了伤疤男，但伤疤男未发现他。伤疤男将在商场发生的案件的推理用别人的手机发给了毛利小五郎。琴酒以及基安蒂等人欲检验赤井秀一是否生还，并以此来证实基尔是否是卧底，却被柯南巧妙地引开。与此同时昴也在寻找伤疤男，而伤疤男却在被瞄准时对着瞄准镜露出诡异的笑容。

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工藤新一来到伦敦，并第四次恢复身体，并且第一次向毛利兰正面表白；同时工藤夫妇知道灰原哀是APTX4869的研发者。

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阿笠博士被绑架，片尾灰原哀再次对冲矢昴表示强烈怀疑。

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自称侦探的世良真纯登场，并转入帝丹高中；之后在柯南平次侦探对决中，茱蒂、卡迈尔在看到世良的照片后表示世良“很像某个人”，而詹姆斯则一眼看出世良是女孩子。

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世良在第一眼看到博士上传的视频时就发现了博士眼镜片中印出来的灰原哀的影子，并向光彦、元太打听了“博士家的小女孩”（即灰原哀）、邻居（即冲矢昴）的情况，可见她对灰原有很大兴趣。并对着冲矢昴的窗户说：“我还以为是谁随随便便地住进来了呢，不过现在看起来真是杞人忧天了啊……”最后世良将视频中意外拍到的灰原影像在电脑中删除。
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自称侦探的安室透登场，在事件解决完毕后自愿成为小五郎的弟子。

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冲矢昴脱口而出的一句“不要露出那种表情”，似乎让灰原感到相当在意。
贝尔摩得给波本打了电话，同一时间冲矢、世良和安室正在接听电话，波本似乎就是这三人其中之一。

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世良似乎对新一早就有了解的样子，并对灰原也表现出兴趣。世良表示自己认识一个“从来不笑的人”，在注意到伤疤秀一的存在后对其相当关注。
灰原回想起冲矢的那句“不要露出那种表情”，和曾在组织卧底的诸星大（即赤井秀一）的用语十分相似。
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开头安室透因之前柯南被绑架的事件被传到警察局问话，返回路中遇到少年侦探团，提到“我到这里也有别的的事情……”；结尾处安室透为高木的指导警官伊达扫墓，暗示两人曾是朋友
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灰原的举动和二人对话表示，冲矢的颈部隐藏着某个秘密
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冲矢昴举止可疑，虽然证实脖子上无异样，但却没有说话，并众人离开后左手拿出之前藏起的梳子。世良在房间中发现了女性线索，冲矢因此被怀疑真实身份，后根据柯南的叙述得知“女性线索”很可能为工藤有希子所留，最后世良含泪回望柯南和兰，说：“果然我是个坏孩子呢。”
699-700
世良问小兰阿笠博士的车子颜色，假装在群马县与柯南偶遇，并试图让柯南通过她的手机与灰原哀联络，而步美等人困在被凶手纵火的小木屋中，灰原为了让大家逃生而服下APTX4869解药，世良对光彦拍下的视频中的宫野志保非常惊讶，另外此段视频也被安室透、冲矢昴通过网络看到。