名侦探柯南大结局
博士是坏人。。毛利是超人
还有，柯南的解药，竟然是爱的力量
阿笠博士的真面目
黑衣人的真正的首脑，就是一直隐藏在他们身边的阿笠博士DOC。LEE。
事情是这样的，工藤优作原先就怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本，所以你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的，而成功后哀的父母意外身亡。阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没有其他的副作用。但是突然有一天，优作和有纪子突然潜回日本，和柯南（103-104集）秘密接触，让他感受到了威胁，于是安排一个间谍时刻跟随在柯南的身边，那就是灰原哀。哀其实是APTX-4689的第一个实验品，本来药的目的是永葆青春，没想到竟然适得其反产生副作用，造成了身体变小。而柯南事件发生后，哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。为什么柯南从来没有被骚扰过就是因为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下。毛利小五郎也是因为追查阿笠才从警界退出的，当时枪击非英里事件只是借口，所以后来暮木说毛利总是把他们引向歧途。
青山刚昌已经给大家提示了，不过因为太晦涩所以没几个人看得出来。其实阿笠这两个字，如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写就是拉丁 文里面的莫里亚帝。所以阿笠博士其实应该叫莫里亚帝教授——福尔摩斯里的罪恶的教授。
柯南结局498话（2小时半特辑）内容完全披露 感人
第一部分：江户川文代二度现身
江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！
柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。
与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。
而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。
在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！
柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。
但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。
原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。
与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。
而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！
第三部份：小说家的意外访客
赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。
因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。
在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。
工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客——目暮警官。
目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死党，自己还当了他儿子的教父！
他就是曾经扬名世界的伟大魔术家——黑羽先生！
优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。
这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。
得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！
而美国也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。
当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。
关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是——“Sherry”。
第五部份：接近
画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。
哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。
这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼
第八部份：江户川柯南VS工藤新一
哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。
柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。
天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。
“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”
“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。
“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”
“哀——”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。
优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。
第九部份：银色弹丸，我们的约定
人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。
一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。
新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。 “终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。” 他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。新一听见步美的声音：“再见了，柯南同学"
本人不才 请大家多多指教
您好，很高兴能回答您的问题^_^
现在柯南没有任何要结局的迹象，前段时间疯传的M 17是大结局的消息绝对是假的。柯南大结局据对不会以大结局形式出现。
至今唯一可信的有关大结局的消息是来自今年4月，青山刚昌出道25周年所作的采访中透露出来的，“台词已经决定了，是‘Happy-End’”。如此的守口如瓶，可以想象这些网上所谓的“青山爆料的大结局”是多么可笑了。
不知你原来看到哪里，是否看到赤井秀一被害和冲矢昴登场？现在又出现了个酷似秀一的“伤疤男”，貌似失忆 + 变哑，但是现在基本可以确定他不是真秀一。
以下是至今为止所有主线剧情剧集：
001 云霄飞车杀人事件 （琴酒、伏特加出场，工藤新一喝下药变小）
002 董事长千金诱拐事件（阿笠博士知道他的身份，工藤新一化名为江户川柯南）
004 大都会暗号地图藏宝事件（少年侦探团成立）
005 新干线大爆破事件（被柯南怀疑的两个黑衣爆炸嫌犯并非黑暗组织）
043 江户川柯南诱拐事件（工藤夫妇知道新一变小）
049 外交官杀人事件（下集）（服部平次登场，工藤新一第一次恢复）
054 电玩公司杀人事件 （龙舌兰出现，被炸死）
058 福尔摩斯迷杀人事件（下集）（平次知道柯南的身份，二人成挚友）
128 黑暗组织10亿抢劫事件 （宫野明美死亡，黑衣组织浮出水面）
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 （灰原哀出场，说出药名是APTX 4869）
162 飞天密室 工藤新一最初的事件 （小兰回忆工藤新一最初的事件）
170 黑暗之中的死角 （上集）（重要人物新出医生登场）
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）（皮斯克出场，任务：暗杀）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）（宫野志保第一次恢复，皮斯克知其身份）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）（皮斯克被琴酒灭口，贝尔摩德出场）
188 危命的复活-洞窟内的侦探团
189 危命的复活-负伤的名侦探
190 危命的复活-第三种选择 （工藤新一第二次恢复）
191 危命的复活-黑衣骑士
192 危命的复活-新一回来了
193 危命的复活-约定的场所
226 格斗游戏的陷阱（上集） （朱蒂出场）
230 谜一样的乘客（上集） （赤井秀一出场）
242 元太的灾难（提到GIN是左撇子）
254 本厅刑事恋爱物语4（下集）（新出医生可能发现了柯南分析案情并利用变声器）
258 来自芝加哥的男子（上集） （詹姆斯·布莱克出场）
259 来自芝加哥的男子（下集） （詹姆斯称呼柯南为福尔摩斯、Cool guy）
269 犯罪的遗物 （上集） （毛利小五郎的卷宗被盗，目标直指柯南）
270 犯罪的遗物 （下集）
272 急忙掩饰的忽略（下集） （柯南被怀疑，形势危急）
274 幽灵屋的真相（上集）（新出医生住所，柯南也认为新出听到了柯南分析案情）
277 英语教师VS西部名侦探（上集） （柯南让博士调查克里斯·温亚德）
284 中华街雨中的似曾相识（上集） （小兰回忆起包含克里斯和秀一的纽约的事情）
285 中华街雨中的似曾相识（下集）
286 工藤新一纽约事件（事件篇） （知道克莉斯就是美国已故大明星莎隆·宾亚德的女儿。）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）（贝尔摩德扮杀人魔登场，赤井秀一对其进行追踪。兰知道秀一是FBI。结尾处，莎隆对有希子说：我也有我的angel了，为后来作铺垫）
307 无声的证据（前篇）（再次抓住黑暗组织的尾巴）
308 无声的证据（后篇）（下一集的引子）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）（柯南得知组织在雇佣电脑工程师编写一个神秘的系统软件）
310 与黑暗组织的接触（追踪篇）（对板仓的日记进行详细研究，获得情报）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）（追踪组织，险些被Gin发现。灰原哀对赤井秀一有感觉）
335 东京现影所的秘密（前篇） （灰原被跟踪，山雨欲来）
339 四辆保时捷（后篇）（朱蒂、赤井发现灰原与黑衣组织有联系、贝尔摩德知道灰原的身份）
340 厕所里隐藏的秘密（前篇）
341 厕所里隐藏的秘密（后篇）（灰原在厕所中找到了妈妈的录音留言）
343 便利店的陷阱（前篇）
344 便利店的陷阱（后篇）（小兰发现茱蒂老师公寓墙后的照片，引起对朱蒂身份的怀疑，为下一集中从朱蒂的后车厢出现，并救下灰原，做出了铺垫）
345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件 （朱蒂、赤井、詹姆斯身份为FBI；贝尔摩德对柯南承诺：放弃雪莉；解释了286-288工藤新一NY事件的全部线索）
346 寻找P股上的印记（前篇） （为上一集善后，茱蒂希望哀参加证人保护计划）
347 寻找P股上的印记（后篇） （哀拒绝参加证人保护计划）
361 帝丹高中的学校怪谈（前篇）（真正的新出医生回归）
375 星星和香烟的暗号（后篇）（柯南听到山村警官给他奶奶打电话的按键音和贝尔摩德给Boss发简讯时的按键音相似，推测Boss在鸟取县）
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（尾奏曲） （Boss的手机号是七个孩子的旋律）
394 怪屋大冒险（封印篇）（Boss的手机号被柯南破解，哀似乎有些了解Boss）
395 怪屋大冒险（操纵篇）
396 怪屋大冒险（解决篇）
425 被组织的魔掌触碰的瞬间 （水无怜奈、基安蒂、科恩出场，烽烟再起）
429 无法回到从前的两人（前篇） （本堂瑛佑出场）
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者 （本堂瑛佑行事奇妙，引起柯南注意）
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星 （结尾提到贝尔摩德的口头禅）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职（这是最精彩的一个系列，不得不看，柯南、FBI与黑衣组织的直面交锋，揭秘水无怜奈的身份其实是CIA卧底，最后赤井秀一为了水无怜奈能继续在组织中潜伏而被杀）
507 卡拉OK包房的死角（前篇）
508 卡拉OK包房的死角（后篇）（本堂瑛佑知道了柯南是工藤新一，说FBI发生了事情时，柯南一边笑，一边说：嗯，没事。使赤井秀一的死更假了……）
509 红白**与侦探团（水无怜奈给朱蒂传递信息，组织派出一名代号为波本的成员专门调查雪莉。冲矢昴出场，灰原哀察觉出异样）
510 柯南VS W暗号之谜 （案子破解，柯南把家借给冲矢昴，并说：作为回报，要好好看家；昴成功躲过兰的攻击，并伪装的像被踢到一样，搏击技术应该不错）
511 推理对决！新一VS冲矢昴（漂亮的推理同步直播，冲矢昴推理能力和柯南不相上下；昴喝波本酒）
521 杀人犯 工藤新一
522 新一的真正身份和兰的眼泪（工藤新一第三次恢复）
525 令人憎恨的蓝色火花（后篇）（顺利破案，柯南和昴配合默契）
542 让鱼儿消失的一角岩（前篇）（冲矢昴代替博士来接少年侦探团，遇上案件）
543 让鱼儿消失的一角岩（后篇）（冲矢昴的言语直逼灰原，灰原再次感到压迫感；结尾处，灰原盯着工藤家说：那个人、果然是……）
563 侦探团VS强盗团（骚乱）（朱蒂被卷入强盗案）
564 侦探团VS强盗团（沉默）（疑似秀一的人登场，并用右手开枪救了柯南；少年侦探团知道朱蒂身份）
578 召唤危机的红色预兆（FBI在寻找秀一；冲矢昴也出现在米花大厦）
579 黑与13的暗示（疑似秀一的男子和冲矢昴同时出现，局势再次混乱，赤井之死遭疑）
580 紧迫黑色的时限（Kir被怀疑身份，琴酒准备让基安蒂狙击疑似秀一的人）
581 红色的摇摆目标（冲矢昴称组织为‘笨狼’，对柯南似乎很了解，言语中好像对柯南传递了某些信息似的；贝尔摩德传来Boss的命令，琴酒命令撤退）
欢迎追问
希望可以帮助你
如果有机会，我要选基德～没错，怪盗基德。
大家不觉得怪盗基德很帅嘛～能力又强，又帅，来无影去无踪的，而且觉的他和工藤新一超级像的，无论是长相，还是行为，做事风格，只是两人一个是侦探一个是怪盗。
基德是很聪明的，他偷东西，也不是为了钱财，完全是为了好玩，哈哈哈，当然，小朋友们这是不对的哦，不能像他学习，把聪敏才智和颜值浪费在这里。
《名侦探柯南》我一直是断断续续看的，比较喜欢看剧场版，因为进展快哈哈～以前只能买碟片看，放假的时候在外婆家和妹妹们一起看，有的时候碟片花了，或者播到某一集没有了，就很心酸呀，总是不知道凶手是谁就进入了下一个案件。但是还是看的很上瘾。小时候明明胆子小还要看，剧终的黑色人影杀手，偶尔露出一口白牙就觉得慎得慌，像看鬼片一般刺激。再大一点就可以自己一个人看剧场版了，可是每次看的时候都神经兮兮的哈哈哈，生怕出来什么恐怖的不在我承受范围内的画面。那个时候，一袭白衣的基德就给我留下了深深的映像。
他的出现总是一部杀人案件的导火线，他一偷东西，场面一混乱，就有人趁乱作案，那个时候就觉得他好委屈呀哈哈哈。有的时候还想过怪盗基德肯定很穷，要不总是那身衣服，也偷不到什么东西。
每次柯南找到他，他就拉开白色滑翔翼，翱翔在空中，少女漫画看多的我，简直控制不住自己驰骋的心，好想和他一起呀哈哈。有的时候我还觉得基德喜欢小兰，后来又觉得他和工藤新一才是真爱，这么多次故意的偷窃，搞得名声很大，会不会就是故意为了引新一出来呢，哈哈我的脑洞太大～
总之，就是要基德～～
主要是讲FBI和黑衣组织的对决，秀一与柯南的完美配合，以及水无怜奈是CIA，是瑛佑姐姐的身份。以及秀一的女朋友是灰原的姐姐——明美。
491 红与黑的碰撞 开始 赤と VOL56F10-F11 2008/1/14
491 红与黑的碰撞 开始
日文名字：赤と
对应漫画：VOL56F10-F11
收视率：96%
播映时间：2008年1月14日
柯南将取得了本堂瑛佑小时候和父亲的照片一事，及本堂的父亲等人的会话内容在电话里告知了平次。2人觉得本堂的父亲与黑色组织之间似乎有某些关联。电话后，柯南与小兰、园子一起前往西米花医院看望初中时的同学。探望后出来，园子在医院的走廊看见了本堂。本堂手持水无怜奈的照片向护士打听着什么…。
492 红与黑的碰撞 血缘 赤と VOL56F11-VOL57F1 2008/1/21
492 红与黑的碰撞 血缘
日文名字：赤と
对应漫画：VOL56F11-VOL57F1
收视率：9%
播映时间：2008年1月21日
柯南等人在看到了本堂姐姐的照片，庵野也只能确认自己只见过怜奈年轻的时候。庵野用旧影像资料进行了确认。那个录像是报导工厂发生爆炸事故的现场节目。由于要输血，护士在寻找AB型的人，当听到需AB型的话时，怜奈作出了要去献血的举动。因此，本堂作出了怜奈不是自己姐姐的结论。此时，柯南打算让本堂告诉大家，他和自己姐姐之间有关血型的事情…。
493 红与黑的碰撞 疾呼 赤と VOl57F2-F3 2008/1/28
493 红与黑的碰撞 疾呼
日文名字：赤と
对应漫画：VOl57F2-F3
收视率：95%
播映时间：2008年1月28日
小五郎接到作为父亲的奥平角藏希望复查于1年前身亡的儿子锻吾的事件的委托。角藏认为家中某人就是犯人。当天，角藏和妻子咏子，女佣人菊代，管家濑川从晚上7点到12点在起居室观看录像带。其间，锻吾在自家泳池溺毙。根据推断，死亡时间为晚9点至10点之间。闻听此言，小五郎便做出不可能是家人犯案的结论，然而…。
494 红与黑的碰撞 冥土 VOl57F3-F4 2008/2/4
494 红与黑的碰撞 冥土
日文名字：
对应漫画：VOl57F3-F4
收视率：94%
播映时间：2008年2月4日
上吊致死的角藏的脚边，放着一本名为《来自黄泉的杀手》的书。封面上的“黄泉”两个字沾有大量血迹，而且还有用血写成的像是平假名“こ”的字。目暮警官等人认为这是死者留下的死亡讯息，于是推断凶手便是死者家中的某一人。就在警官一一确认众人的不在场证明时，柯南留意到了桌上角藏的便条本…。
495 红与黑的碰撞 昏睡 VOL57F9-F11 2008/2/11
495 红与黑的碰撞 昏睡
日文名字：
对应漫画：VOL57F9-F11
收视率：92%
播映时间：2008年2月11日
柯南向灰原讲述了本堂瑛佑的姐姐和水无怜奈并不是同一个人。柯南回家后兰告诉他，自从放寒假就联系不到本堂了，并且说在寒假之前好像听到本堂说过在杯子户中央医院发现了什么线索，柯南以为是水无怜奈所在的医院被本堂找到了。但其实本堂所讲的线索是指他音信皆无的父亲，他好像是找到了他父亲公司的同事…。
496 红与黑的碰撞 入侵 2008/2/18
496 红与黑的碰撞 入侵
日文名字：
对应漫画：
收视率：82%
播映时间：2008年2月18日
杯户中央医院的护士雅江告诉柯南，本堂瑛佑在别家医院里动过手术一事。据说本堂曾患白血病，在搬来大阪前动了手术。随后，FBI成员James前来报告，潜伏在医院的黑衣组织成员就在右脚骨折的新木张太郎、颈椎扭伤的楠田陆道和急性腰痛的西矢忠吾这3人之中。James等人寻思着如何找出那人…。
497 红与黑的碰撞 觉醒 2008/2/25
497 红与黑的碰撞 觉醒
日文名字：
对应漫画：
收视率：98%
播映时间：2008年2月25日
深夜，打算寻找组织同伙的楠田潜入了护士值班室。朱蒂等人虽打算进行抓捕，但是楠田趁乱逃走。随后，楠田驾车逃跑途中，发觉被赤井跟踪，遂自杀。朱蒂对组织调查怜奈病房的事情，没有成功稍感安心，但GIN，Vodka等人已经察觉Kir（怜奈）就在杯户中央医院一事。GIN为了营救出Kir，而在制订着下一步计划…。
漫画的版本
http://wwwggyy8com/Html/K/Conan/indexhtml
File599 赤井の过去 内容简介GIN等人已经得知水无怜奈目前在杯户中央医院，于是立即驱车前往，打算从FBI的手中夺回水无。
朱蒂主张立即把水无转移，可是，赤井说医院隔壁大楼的屋顶上，有人正在监视着他们。于是，众人只得继续驻守在医院，等待组织成员的到来。
朱蒂发现赤井似乎很高兴，便一再询问。无意间，柯南得知了，赤井的女友竟是灰原哀的姐姐－宫野明美！！
由于要研究如何对付组织成员，赤井离开了水无的病房，前去参加作战会议。此时，瑛佑却偷偷来到了水无的身边……正欲用剪刀刺杀水无时，水无突然睁开了眼睛……
另一方面，在会议室外，一名新增援的搜查官，正在打电话，形迹可疑……
File600 听天由命
朱蒂他们继续开会商讨应付组织成员的对策。虽然已经到了很危险的境地，但是，依然决定不到万不得已，不冒险将水无怜奈从杯户中央医院转移出去。在讨论的同时，朱蒂也注意到了那位有点面熟的FBI成员。而赤井秀一的情绪好像有些不稳定，又想起明美遇害的事情了吗？
另一方面，FAMILY餐馆里，某位顾客忽然腹痛难忍，整个餐馆里的人集体食物中毒；TR杯户站，候车的乘客忽然闻到一股怪味，眼睛、喉咙很不舒服；杯户**院突然发生了火灾，现场一片混乱。得知这一切的赤井，嘴角露出了一丝自信的微笑。
那时，快递人员送来一盆洋牡丹给詹姆斯，正式宣战。而委托人竟然是前一天自杀身亡的组织成员楠田。正当朱蒂他们进一步揣测组织送花的用意之时，3起突发事件的受害人大量涌入杯户中央医院。朱蒂和詹姆斯担心组织成员乘机混入医院，熟知组织的赤井坚信组织成员不会冒险乔装进入，一定是另有打算
此时，洋牡丹的花盆里突然发出了奇怪的声响，这声响越来越大File601 掩饰
赤井他们从花盆里找到了一个定时炸弹，31分14秒之后将自动引爆。由于炸弹的分解似乎很费时间，朱蒂打算开车将 炸弹扔到7公里外的垃圾场去。可是，3起事故不但造成了大量伤员涌入医院，还造成了交通大阻塞。留守在医院的赤井和柯南，察觉到这是黑衣组织故意将FBI 引出医院的一个圈套。
此时，朱蒂在那个可疑的FBI的带领下，打算抄近路去垃圾场，却依然遭遇了塞车。可疑的FBI用计顺利地取代了朱蒂司机的位置，朝着垃圾场的反方向飞驰而去。最后时刻，炸弹被扔入了海中，成功处理完毕。
医 院这边，拥挤的人群中，柯南和赤井意外地又发现了很多来自楠田陆道的快递包裹，接收人是各个病房的患者。这些快递包裹里，全部隐藏着炸弹，每个炸弹的威力 足以炸掉一个病房。幸运的是，这些炸弹的引爆时间设定在5点，现在离5点还有4个小时。柯南和赤井推测，黑衣组织根本没打算营救水无怜奈，他们是想杀人灭 口。
朱蒂他们前往一个个病房搜查炸弹的踪迹，却惊讶地发现水无怜奈出现在TV上File602 最终手段 内容简介
水无怜奈在TV上的出现，引起了FBI的慌张，众人的第一反应就是赶往水无怜奈的病房查个究竟。柯南和赤井瞬间洞悉了黑衣组织狡猾的伎俩，可是，已经来不及阻止飞奔而去的FBI们。
在水无怜奈的病房，大家看到了还在昏迷中的水无怜奈。而那段在TV上的影像，只不过是利用了水无怜奈入院时的影像合成制作的。而黑衣组织的目的，就是让搜集了炸弹的FBI们聚集，从而通过炸弹上的发报机查出水无怜奈的正确方位----第4病栋307室。
由于水无的行踪暴露，詹姆斯决定采取早上说起的最终方案----用3辆车搅乱组织的视线，乘机将水无怜奈运出医院。柯南提议用博士的甲壳虫运送水无怜奈。可是，赤井阻止了柯南，不再让柯南参与，并说受柯南启发想出了绝妙的方法。
运送水无离开的重任，落在了那名可疑的FBI卡梅尔身上。朱蒂突然意识到卡梅尔撒了谎，却没有当着众人的面揭穿他，打算私下找他问问，却被他弄昏了过去
File603 任务
为了混淆黑衣组织的视线，FBI们分开乘3辆车护送水无怜奈离开。装载水无怜奈的那辆车，是由卡梅尔驾驶的。但是，伏特加、chianti（奇扬第）、colum他们的车早已守候在医院外面！而赤井的车里，竟然坐着柯南，贝尔摩紧随其后！
根据测温仪图像上的数据，伏特加他们判定，赤井跟着的那辆车装载着水无怜奈。Gin看穿了FBI的把戏，说那只是假象，水无在卡梅尔开的车里。卡梅尔被黑衣组织包围了。
卡梅卡运用高超的驾驶技巧努力甩开黑衣组织，却被恢复意识的水无打晕了。紧急刹车后，水无跳车顺利逃脱。那时，车子发生了爆炸，上面还载着卡梅尔。
找回了水无的黑衣组织，碍于爆炸引来的看热闹的人越来越多，只得迅速撤退。
此时，卡梅尔说了一句“成功了”。赤井对卡梅尔说，“你辛苦了”难道，这也是柯南和赤井的计划！？
FBI、発车准备完了。
FBI、已做好发车准备。
増员捜査官、ジョディが出て行ったとFBIのおっさんに。
増员捜査官、告诉FBI的大叔说朱迪出去了。
车の阴にジョディ。
车的阴影下的朱蒂。
场面変换で组织。ライフルのスコープでFBI车の発进确认中。
场面切换。组织。正在用来复枪瞄准装置确认FBI车的出发。
キャンティが1台目、コルンが2台目、ウォッカが三台目。
基安蒂是第一辆，科恩是第二辆，伏特加是第三辆。
长髪は病院周辺で待机らしい。会话。长髪「奴からの一报はまだない…」
琴酒好像在医院周围待机。对话。琴酒：“还没有收到那家伙的报告”
场面変更で増员捜査官。追迹はなしと报告。后ろにバイクがいる。
场面切换。増员捜査官。报告说没有被跟踪。后方有辆摩托车。
キャンティ、1台目に近付く。スモークで中は见えない。
基安蒂、靠近第一辆。车窗是茶色的看不见里面。
サーモグラフィで撮影。
用测温仪录影。
场面変更で长髪。三台分の映像。1台目、9人で発信机あり。
场面切换。琴酒。第三台的映像。第一台、9个人有发信机。
2台目、9人で発信机なし。三台目、2人で発信机あり。
第二台、9个人没有发信机。第三台、2个人有发信机。
三台目が増员捜査官。长髪に连络入る。赤井の车発见とのベルモットからの连络。
第三台是増员捜査官。琴酒接到联络。是贝尔摩德的联络，说发现赤井的车。
赤井とコナン、ベルモットに気づく。
赤井和柯南、察觉到贝尔摩德。
赤井、前の车を抜きまくる。长髪以外、2台目と予想。
赤井、超过前面的车。琴酒之外、猜测是第二辆。
长髪、三台目と断定。
琴酒、断定是第三台。
助手席が怜奈で移动と见せかけて病院に戻るつもりだったと推理。
推测：助手席是怜奈，装作在移动，打算返回医院。
FBI、组织が三台目を追ってることに気づく。
FBI、注意到组织在追第三辆。
増员捜査官、殴られる。事故。
増员捜査官、被殴打。事故。
怜奈、组织と合流。増员捜査官、ライフルで狙われる。车、爆発。
怜奈、与组织会合。増员捜査官、被来复枪阻击。车、爆炸。
野次马登场。组织退场。
围观者出现。组织退场。
増员捜査官「せ、成功しました…」と连络。
増员捜査官在联络：“成、成功了…”
连络先は赤井。コナンと赤井、笑って以下次号。
联络对方是赤井。柯南与赤井、笑。接下来请见下期。
File604 姐弟
将水无怜奈还给组织，原来是柯南和赤井计划中的事情。
事件前一晚，赤井匆匆离开水无的病房，装成参加紧急会议的样子，故意制造机会让本堂接近、并叫醒了水无怜奈。然后，柯南突然出现，讲述了本堂因为白血病的手术，血型从O型变成了AB型的事情。随后，挑明了水无是CIA的事实。
水无和本堂的父亲，作为CIA的NOC先后潜入黑衣组织。但是，由于水无的失误，两人秘密接头的事情败露了。本堂的父亲为了洗清水无是CIA的NOC的嫌疑，牺牲了自己。而水无之前接触毛利小五郎，是希望小五郎能够保护瑛佑。
本堂身上的一切谜团慢慢解开了赤井和柯南却向水无提出了让她重新回归组织的请求
File605 意外的嫌疑犯
据柯南和赤井说，水无怜奈之所以答应他们再次潜入组织成为卧底，是因为他们愿意替本堂瑛佑申请证人保护，还答应了水无怜奈在组织里的行动可以优先满足CIA的任务。
而GIN则因为赤井的关系，有些心神不宁。
之后，柯南和侦探团、灰原他们一起去吃宾馆的自助餐。和以往一样，在那里发生了杀人事件，被害人是艺人事务所的社长。
根据调查情况和柯南的推理，那个潜伏在宾馆中的、被认为是嫌疑犯的外国人，被带到了案发现场。
但是，那个可疑的外国人竟然是卡梅尔搜查官！
File606 黑色星期五
众人推理出3名嫌疑人，他们分别是，一直在顶楼的饮食街上徘徊的托比・凯英兹、藏在顶楼卫生间内的哈尔・巴库纳、大汗淋漓地跑下楼的安德鲁・卡梅尔。
托比解释说自己当时正在犹豫去哪儿吃饭；哈尔则说在为某位学生的事情烦恼着；卡梅尔当时正在锻炼身体。眼看大家越来越怀疑卡梅尔，柯南不得不请来朱蒂老师澄清误会。
目暮警官认为死者并不是中弹而亡，而是吃了有毒物质才丧命的。调查死者握在手里的小纸片后得知，纸上的“把我的晚礼服拿来”确实是死者的笔迹……
另一方面，大厦顶楼，水无怜奈打电话向电视台人事部长辞职。此时，琴酒突然出现，并给水无带来了boss的命令……！
File607 卡梅尔的过去
琴酒要求水无怜奈除掉赤井秀一，以洗清她自身的清白。琴酒对于FBI的行动位置非常了解，知道他们因为一桩杀人事件，还被牵绊在医院。琴酒提出要水无怜奈立刻将赤井秀一骗来
2年前，由于卡梅尔的失误，使得潜伏在组织的赤井秀一身份暴露，由此间接害死了明美。赤井秀一接到了水无怜奈的电话，虽然知道很可能是陷阱，但是，为了保护水无怜奈在组织的安全，依然打算只身赴约。
另一方面，目暮警官他们还在研究死亡讯息“Bring my tux”死去的社长秘书认为，这是社长留给她的话，因为晚上恰好有晚会。在录音电话中，也有一通秘书的电话，留言中也有提到晚礼服。高木刑警坚持认为“Bring my tux”的留言一定和事件有关。少年侦探团一说到晚礼服，就想到从事模特职业的托比。在柯南的提示下，朱蒂解开了死亡讯息隐藏的真正内容！
File608 魔法咒语
柯南搬出了新一哥哥那边听来的魔法咒语，说是立刻可以知道犯人是谁。目暮警官将信将疑地为柯南的推理秀准备起来。
按照柯南的要求，高木刑警搬来了4张椅子，让4个嫌疑人分别站在4张椅子前面。万事俱备，目暮警官喊出了那句魔法咒语----听上去有点像英语的“sit down please”。除了托比依然站着以外，其余3人同时坐下了。
在朱蒂老师的提示下，高木刑警推理出了凶手就是不懂英语的托比。而被凶手带走的那张留言，也在托比身上找到了。
另一方面，赤井秀一在来叶崖第7个左拐弯处，见到了等待中的水无怜奈。远处，琴酒和伏特加通过监控器关注着两人的会面。水无怜奈突然拔出手枪射向赤井
File609 钢楔
在琴酒的监视下，基尔先是一枪打中了赤井的肺部，之后又对准赤井的脑袋开了一枪。枪声引来了不远处的警察，基尔在赤井的尸体上放了一个炸弹后，随即撤退。3秒钟后，炸弹爆炸，毁尸灭迹。
另一方面，詹姆斯告诉朱蒂，赤井单独去见基尔了。此时，传来了来叶崖有一辆车子爆炸的讯息。朱蒂和詹姆斯决定在不暴露死者可能是FBI的前提下，去警视厅确定死者是不是赤井。
高木刑警告知朱蒂，通过手机上的指纹调查，确定死者的指纹也出现在手机上。可是，高木暂且留下了朱蒂带去的柯南的手机，还了一个同型号的手机给柯南。柯南发现手机序列号变掉了，似乎明白了一切…File610 声音妃英理和以往一样，来到经常光顾的美发店美发。店长是一位29岁的年轻女子叶坂皆代，她告诉妃英理说，店里的员工都下班了，只剩下她一个人。刻意隐瞒了店内还有一位年轻男子-----28岁的格斗家永作司朗。
另一方面，在兰的监督下，小五郎驱车前往美发店接妃英理。在车子经过美发店附近的坡道时，小五郎、兰、柯南三人同时听到了撞击、坠落和滚动的声音，下车察看四周，在坡旁的垃圾堆上发现了一具尸体，死因是颈动脉被割断。
柯南仔细观察了死者的伤口后，发现伤口上沾了很多细小的头发屑，于是，盯上了身为美容师的叶坂皆代File611 会飞的尸体小五郎怀疑叶坂皆代是凶手，可是，英理多次以“死者是90公斤的格斗家，弱女子不可能有杀害他并移尸的能力”及“叶坂**只有去便利店前的2-3分钟和离开便利店后的2分钟没有不在场证明，在那么短的时间内不可能犯下罪行”为由，极力地为她辩解。
另一方面，叶坂在柯南说“大姐姐腹部处的衣服上粘着金发哦”时，表现得异常慌张…
File612 力学和不在场证明
妃英理始终认为自己的美发师没有犯罪的可能。但是，小五郎坚决认为凶手就是叶坂**，她一定是用了某种方法杀死了自己的前男友永作。双方僵持不下之时，柯南已经看破了一切，并且当场重现了犯罪手法。与之前柯南他们听到的撞击、坠落和滚动的声音完全一致。
柯南正要继续借用小五郎的声音举出关键的证据之时，因为一场意外，小五郎被砸醒了。妃英理非常漂亮地接着推理下去，揭开了事件的真相File613 蜈蚣
由于受到虎田直信的委托，小五郎和兰、柯南一同来到了位于长野县深山里的虎田家中。虎田直信的儿子义郎被龙卷风卷走，一天后，尸体被沉迷于寻宝的另一个儿子繁次发现。而且，在尸体的头部旁边竟然有一具蜈蚣的尸体，据此，虎田直信认为儿子是被长年不和的龙尾家的人杀害的！
另一方面，龙尾家当家的龙尾为史的儿子康司前不久也被杀害了。尸体的旁边，也放有一具蜈蚣的尸体。发现尸体的同样是另一个儿子龙尾景。为查明儿子的死因，龙尾为史找来了服部平次追查真相。龙尾为史的母亲龙尾盛代认为一定是虎田家的人干的！
柯南和平次，因为这两件奇怪的事件而在长野县偶遇，开始了各自的调查。在调查过程中，又发现了另一个关于6年前摔下悬崖惨死的甲斐玄人的事件File614 铠武者 内容简介根据虎田义郎的妻子由衣的描述，6年前甲斐巡警虽然意外坠崖，但是真正的死因是饿死。当时，甲斐巡警坠崖后，全村的村民及刑警，曾经拼命寻找过他的尸体，却始终找不到，直到一周后才找到。据此，柯南他们认为此次的事件和6年前的事件有关。
为了进一步获取更多的线索，柯南、平次、小五郎三人前往龙尾家，而和叶和兰留守在虎田家。当晚，和叶和兰隔着拉门看到了武士的亡灵。
第二天，送柯南他们回虎田家的绫华听说了和叶她们前晚遭遇到的事情之后，突然间害怕不已，躲进了厕所。之后，绫华的手机响起。
等到龙尾家的人来到虎田家，绫华已经消失。寻找绫华的柯南他们在树林里遇到了大和刑警，同时发现了吊在树上的绫华的尸体！
File615 兵法
从绫华的尸体周围的状况来看，雨后的地面上并没有留下凶手的脚印，树上也没有攀登过的痕迹，大和刑警判定这是不可能犯罪。而遗留在绫华尸体旁的蜈蚣，怎么看都像是武田信玄传达队的徽章。
原来，被杀的三人、以及虎田繁次、龙尾景，自从发现了关于武田信玄宝藏的线索后，就热衷于寻宝。大和刑警断定，下一个遭到袭击的就是虎田繁次或龙尾景。
回 到虎田家，柯南和平次在前晚武士的亡灵出现过的地方，找到了蛛丝马迹。在得知龙尾家也有铠甲后，再度前往龙尾家。在龙尾家，柯南和平次得知了死去的虎田义 郎、龙尾康司只是养子，与虎田家、龙尾家没有血缘关系。同时，也终于注意到凶手是根据有名的兵法「风林火山」来杀人的！！File616 风林火山
虽然妻子龙尾绫华死于意外，但是，龙尾景依然认真地练习骑射。标的物，却被邻村人悄悄移动了位置。原来，过些 天的骑射比赛是代代相传的两个村子间的荣誉之争。如果获得了比赛的胜利，就可以在之后的一年内在颜面上完全压倒对方。6年前，龙尾景和甲斐巡警在预选赛中 都射出了全中的好成绩，约定第二天再比，结果，甲斐巡警失踪了
另一方面，小五郎找回了依旧迷恋着宝藏搜寻的虎田繁次。回家的半路上，虎田繁次忽然消失。不远处的电车前，出现一个大火团，似乎是一个人被烧着了，难道那个人是虎田繁次？File617 战
火扑灭了，尸体从头到脚都被烧焦了，无法从外貌上辨认。大和刑警从尸体的体型上判定，这个人就是虎田繁次。根据进一步的调查，证实了虎田繁次是“利用”钓鱼竿搭到电车高压电线上触电身亡的。案发现场，同样出现了蜈蚣的尸体。至此，按照“风林火山”兵法的杀人告一段落。
现场还发现了一本写着宝藏寻找过程的记事本，里面还有死去的四个人的交换日记，记录了6年前甲斐巡警死亡的事件。据此，大和刑警推断虎田繁次是杀死了另外三人后，自杀身亡的。
柯南和平次却在现场又找到了可疑的、新的线索。再次前往发现绫华尸体的案发现场。在那里，和刑警的交谈中，柯南和平次获知了不少关于甲斐刑警死亡时的情况，以及大和刑警和上原**的过去，更重要的是，两个人终于找到了解开案件的突破口！！！File618 阴和雷
众人回到虎田家，等待第二天警方的进一步调查取证。
虎田由衣独自一个人来到了虎田景的练功房，对他说出了凶手的杀人兵法并非“风林火山”，而是孙子兵法中的“风林火山阴雷”。虎田繁次是死于“雷”，而不是之前所说的“火”。六年前的甲斐巡警，则是死于“阴”。如此一来，还剩下一个“火”，是凶手留给虎田景的！！
此时，真正的凶手也来到了练功房，打算用“火”结束虎田景的生命，同时也瞄准了为调查恩师甲斐巡警死亡的真相，而嫁给虎田义郎的由衣！
关键时刻，平次、柯南、大和刑警的突然出现，完全破坏了凶手原先的计划。众人顺利地将真凶缉拿归案。File619 瑛佑的嫌疑
放学后，柯南、少年侦探团、哀一起去逛书店，偶遇兰、园子、以及刚刚复学的瑛佑。出了书店以后，柯南和哀察觉到有人尾随，猜测是保护瑛佑的FBI人员。可是，瑛佑再三表示自己喜欢自由、不喜欢被束缚。
为了庆祝瑛佑复学，兰、园子她们带着柯南，一起去了卡拉OK。那个尾随的可疑人也来到了卡拉OK。瑛佑说要去一下洗手间，竟然一去半个多小时。回来的时候，脸色发白，直嚷着要快点从这里逃出去。
正当柯南他们退房，准备离开的时候，在另一个卡拉OK房间里，发生了杀人事件！死者正是那位一直尾随柯南他们的男人！！难道和瑛佑有关？ps 兰和园子在卡拉OK唱的是《昨日的泪》啊，呵呵。
File620 消失的钝器
杀害谜一样的男人的凶手，就在包括瑛佑在内的4个人中。瑛佑终于说出了自己慌张提出离开的原因，原来他看见了某个房间里，有两个男人在接吻！而事实上，那并非是两个男人，而是一男一女。
从死者跟踪柯南他们拍下的照片来看，所有的照片，均是以园子为中心的。可见，他的目标不是柯南一直认为的瑛佑，而是园子！
察看了4位嫌疑人所在房间以及随身携带的物品后，柯南终于找到了消失不见的钝器和真正的凶手！
File621 瑛佑的告白
柯南将园子麻醉后，借用园子的声音揭露事件的真相。原来，一直尾随瑛佑他们的那个男子，真正的目的是绑架园子！凶手的动机是复仇，因为这个男子曾经绑架过凶手的儿子，并将其杀害。
凶手将大量的10元硬币塞入袜子里，行凶后，再将10元硬币放入自动售货机，买香烟。凶器就这么消失的无影无踪了。
案件解决后，柯南在中途与兰她们分道扬镳，瑛佑却跟了过来。瑛佑试探柯南说，想问问看新一自己可不可以向兰表白？柯南的表情和回答，让瑛佑确定了柯南就是新一。瑛佑似乎从一开始就看出了柯南就是新一。而回到学校，是想和学校的朋友们告别，然后到美国努力成为CIA。
在说到FBI好像有人牺牲的时候，柯南的嘴角露出了一丝笑容
http://dzhmopcom/whbm/20100227/0/OzFg8lIa83a558llshtml
银色子弹的怒吼－赌上侦探之名的决意！》
第一部分：江户川文代二度现身
江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！
柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。
与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。
而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。
在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！
柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。
但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。
原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。
与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。
而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！
第三部份：小说家的意外访客
赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。
因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。
在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。
工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客--目暮警官。
目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死party，自己还当了他儿子的教父！
他就是曾经扬名世界的伟大魔术家--黑羽先生！
优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。
这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。
得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！
2 名侦探柯南大结局(转)
而美国go-vern-ment也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。
当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。
关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是--“Sherry”。
第五部份：接近
画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。
哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。
这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼唤，兰终于爆发奥义，一击之下击倒了号称不败的风间。
Judy正要枪杀哀时，Gin突然出现了，把枪口对准Judy。他命令Judy放下枪，并说哀对组织还有用。Judy奇怪的问：“不是你要我到这里来杀死她的吗？”Gin突然扣动扳机，一张扑克牌打中了Judy的手。原来这个Gin是基德扮成的。基德让哀先去救柯南，自己在这里看着Judy。
哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而这一切都被组织内部的摄像机拍摄到了。
这时优作也已经赶到了东京，越来越多的信息汇集起来，在他的特殊计算机分析下显示出了一个结论。优作看着屏幕目瞪口呆。
第六部份：真相只有一个
Gin和Vodka不知去向，哀顺利的找到了柯南。原来在地下还有组织的列车，两人乘着封闭的列车来到了组织的“圣殿”。
圣殿的正前方是一块巨型液晶墙，上面出现的居然是前首相吉田的脸，他神色狰狞的说出一切。
秘密被完全的解开：基德和他的父亲黑羽之所以以宝石为目标，并不是因为宝石值钱的原因，而是因为其中的一块宝石并非出于地球，而是来自银河系之外！它特殊的物质可以放出特殊的射线，改变细胞的分裂成长方向，从而让细胞获得永恒的生命！
为了在黑暗组织之前找到宝石，黑羽本人假装葬身雪地，让自己的儿子扮演怪盗来寻找宝石。但基德却也一直没能找到它。因为宝石很早就已经落入了黑衣组织之手，也正是在宝石射线的启发下，黑衣组织才开始了“不死药”的计划。
但又因为想要合理的释放出宝石的能量必须解开特殊的方程，需要设计出高级的程序来计算射线的不同状态，组织于是才在世界范围内招募最一流的电脑程序员。
屏幕上吉田所有的话被阿笠博士用无线电传给了外面的毛利等人，大家都非常惊讶。哀说：“不要再躲躲藏藏了，快出来和我们一决胜负吧。”
“恐怕他是不会出来的。”柯南低下头，眼镜闪着银色的光芒说出了令人震惊的话：“因为他早就死了。”
第七部份：人的战斗
柯南完美无暇的推理出了不可思议的结果：吉田首相早在5年前就死去了，杀手正是这个地方的安全保卫系统。也就是说，现在黑衣组织的最高头脑，就是这台具有人工智能的电脑而已，它以利益时间比最大化的程序来发布组织的命令。
屏幕上的吉田哈哈大笑承认自己的身体的确因为心脏病而失去功能，但自己的脑组织结构和DNA数据被完整的保存在的超级计算机中。只要方程能够被解开，自己就能获得重生。这时电脑突然显示射线的方程被解开了，重塑吉田的工程开始。
吉田哈哈大笑，但相关的机器突然爆炸。还是胚胎条件的新的躯体毁灭了。原来是电脑AI自己下了这个命令，并将吉田的所有数据都删除了。AI认为自己完全统治黑衣组织才是最大化的利益。
这时大殿的顶棚突然打开，地面升了起来。柯南发现他们居然到了在停K在东京湾的巨轮甲板上。原来这艘作为黑衣组织大脑的巨轮长期飘荡在太平洋中央，用通讯卫星来操纵世界各地的成员。
站在甲板上迎接他们的是持枪而立的Gin。
Gin向柯南扣动了扳机。
第八部份：江户川柯南VS工藤新一
哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。
柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。
天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。
“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”
“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。
“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”
“哀--”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。
优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。
第九部份：银色弹丸，我们的约定
人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。
工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。
一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。
新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。
“终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。
新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。”
他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。
新一听见步美的声音：
“再见了，柯南同学。”
1剧场版 OVA TV版 特别篇 漫画版 真人版 小说版（注: 两部真人版是根据小说版改编，TV版是根据漫画版改编） 剧场版 OVA 是原创
2大结局目前还没有 不过网上盛传的倒是不少 最出名的应该是这个
工藤优作原先就怀疑并且侦察黑衣组织。以小说家的身份为掩护，秘密调查。发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑阿笠家的隔壁住，并且从小培养新一，并派新一和阿笠混熟想借此侦察一些情报。当阿笠开始怀疑工藤父子的时候，想出一条毒计，他派GIN和沃克跟踪出去约会的小兰和新一，大家都看过第一集，其实交易是幌子，真正的目的是跟踪，于是新一也就被他们变成了柯南。之后，阿笠顺理成章地成为了新一的同伴与监护人，并且柯南实际上成了阿笠手中的人质，当时新一的父母第一次出现的那一集，实际是和阿笠谈判的，最终的结果是阿笠以柯南要挟他们两个人流放到瑞士。而优作因为不能和新一说明真相，从而让新一感到受骗，受到伤害。只能同意阿笠的要求，不再回日本，所以你们看优作只有103集的时候回过日本，还是变装的，不能让阿笠发现。
其实APTX-4689就是阿笠和灰原哀的父母联合开发的，而成功后哀的父母意外身亡。阿笠留着柯南不死只不过想观察药品还有没有其他的副作用。但是突然有一天，优作和有纪子突然潜回日本，和柯南（103-104集）秘密接触，让他感受到了威胁，于是安排一个间谍时刻跟随在柯南的身边，那就是灰原哀。哀其实是APTX-4689的第一个实验品，本来药的目的是永葆青春，没想到竟然适得其反产生副作用，造成了身体变小。而柯南事件发生后，哀就成了在柯南身边卧底的最好人选。为什么柯南从来没有被骚扰过就是因为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下。毛利小五郎也是因为追查阿笠才从警界退出的，当时枪击非英里事件只是借口，所以后来暮木说毛利总是把他们引向歧途。
但是这都是网友的猜测，青山老师从未写过结局
3048 外交官杀人事件（上集）
049 外交官杀人事件（下集）
188 危命的复活 洞窟内的侦探团
189 危命的复活 负伤之下的名侦探
190 危命的复活 第三个选择 （从这集开始）
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
521 杀人犯-工藤新一
522 新一的真实身份与兰的眼泪
523 真正想问的事
剧场版：
07 迷宫的十字路口
4灰原哀 服部平次 工藤优作 工藤有希子 阿笠博士 苦艾酒
另外在即将推出的剧场版M13 漆黑的追踪者 中 黑暗组织的GIN 琴酒 好像已经发现了柯南是工藤新一
すべての発端はヤツらと出会ったコト・・・
所有的开端都是因为和他们相遇…
因縁の黒ずくめの男达と宿命の対决！！！
因缘的黑衣男子和宿命的对决
《漆黑的追踪者》（漆黒の追迹者）是名侦探柯南系列剧场版的第十三部。其前作为《战栗的乐谱》，柯南映画版（剧场版）在剧情上悬念的设置和情节铺垫都很巧妙，动画制作也优于TV版的制作水准，可看性高，在大荧幕上，柯南将带我们进入另一推理巅峰！此次作品和柯南原作联系甚为密切，本次剧场版讲述的是柯南与用毒药将其身体变小的宿命之敌“黑衣人”的对决的故事，是继剧场版5之后柯南与组织的再次对决。它关系到柯南整部主线剧情的走向，所以柯南迷，就一定不能错过。《名侦探柯南》最新剧场版自从公布了制作消息以来，又把近两年来备受柯南剧场版摧残的柯南饭们的心吊了起来。本站10月底曾介绍过这部剧场版已经定名为《漆黑的追迹者》（《THE RAVEN CHASER》）、人们更愿意翻译成《漆黑的追踪者》），这个故事和《柯南》全系列的起点相连接，而有着相当人气的黑衣男琴酒的出场，想必还是会备受关注的。它的公映日期已经正式定在了09年4月18日。在官方网站上，目前公开了具体的制作成员和剧透等情报，它的最新情报将随时在TV版和《周刊少年SUNDAY》上公布。
每年的4月18日在全日本开始公映，台湾地区一般会在当年7月也进入公映，中国大陆未有影院播放历史。日本当年10月左右会发售正版DVD，届时大陆才可引进并观看。此前请不要轻信网络上的在线观看、下载等谣言。
30秒预告片
（估计是BOSS）：“那个被组织的药解决掉的叫工藤新一的高中生侦探小鬼，还在以小孩的身份活着。”
哀：组织是想把和你有关的人全都抹消掉啊！
Gin：做好觉悟了吧，江户川柯南，不，工藤新一。（子弹从枪口射出）
小兰：柯南！
目暮警部被刺了一刀，佐藤警官被基安蒂瞄准。
[编辑本段]制作
动画制作：东京MOVIE
技术支持：（株）YAMAHA MUSIC MEDIA徽章
制作：小学馆/读卖电视/日本电视/小学馆SHOPRO/东宝/TMS
上映：东宝
原作：青山刚昌
导演：山本泰一郎
剧本：古内一成
音乐：大野克夫
柯南剧场版历史上有很多编剧，野泽尚（M6）、柏元宽司（M10）、古内一成（编得最多的编剧），编剧决定着柯南的整体可看性，蔚蓝色的海盗旗可谓是最差的一次编剧，你们可以猜测一下此次编剧是谁
M1至M7导演均为儿玉兼嗣 ，其有柯南功臣之称啊！从M8开始就换为TV制作导演山本泰一郎，而柯南剧场版也开始下坡路，导演力量不可小看！
[编辑本段]故事简介
在东京市中心发生了6件大范围的连续杀人事件。警方除了目暮警部之外，还派了各县的警员增援，小五郎也参加了搜查会琴&柯南议。此时柯南却因为一个偶然的契机，发现一个警察从会议中离席，并乘上了一辆跑车离去。
“那辆车……居然，是琴酒！！”
“黑衣人组织”中的一员居然潜入了搜查会议，琴酒肯定是想乘坐跑车逃走。
连续杀人事件莫非是“黑衣人组织”做下的罪恶勾当？
事态一触即发！！
如果让琴酒知道工藤新一仍然活在这个世上，那么不止新一本人，只要和他扯上关系的朋友们都会被从这个世上抹杀掉。 Gin
所以在明知危机四伏的情况下，柯南仍然开始单独进行调查！
柯南剧场版第13弹，死亡游戏现在开始！！
[编辑本段]悬疑
黑暗组织的魔手终于伸向了柯南和灰原，以及周围的人们！！
在这里，发现柯南真正身份，逐渐逼近柯南的琴的身影是！？ 果たしてこの人物は!
说起来，这次的故事是在东京，神奈川县等地方发生连续杀人事件！
各县警视厅的刑警集合了起来，召开了搜查会议。
然后，柯南目击到从会议中溜出来的1人的身影，乘上了琴的爱车！！
柯南因为深知这事的危险，于是向连续杀人事件的调查发起了挑战！
最终，被逼入绝境的是Gin，还是柯南呢！？
请继续关注我们的后续报道！！ 目暮警部たちの身にも危害が!
黑暗组织新成员出现！！
特别报道影像中，被派出的组织新成员的容貌！！
潜入搜查会议的是这个家伙吗！？
就连平时冷静的灰原也难以掩饰出不安…！？
平时就连鲁莽的事情都面不改色的灰原，到底发生了什么…！？
降落到目暮警官们身边的危险是！！ 灰原のこの惊きの表情は一体…!
隐瞒了真实身份的柯南所担心的事，终于变成了现实。
那么柯南及其亲密的人们会被袭击吗…！？
兰会没事吗！？
[编辑本段]声优
侦探们的镇魂歌中，元谷光彦的声优大谷育江由于健康情况不佳，无奈换掉，而最新作战栗的乐谱中已经恢复原职。可喜可贺
江户川柯南（江戸川 コナン）(Edogawa Conan)…………… 高山南
工藤新一（工藤 新一）(Kudo Shinichi)…………………… 山口胜平
怪盗基德（黑羽 快斗）（Kuroba Kaito）……………………………山口胜平
毛利兰（毛利 兰）（Mouri Ran）……………………………山崎和佳奈
灰原哀（灰原 哀）(Haibara Ai)………………………………林原惠美
毛利小五郎（毛利 小五郎） (Mouri Kogoro)…………………神谷明
铃木园子（铃木 园子）(Suzuki Sonoko）……………………松井菜樱子
阿笠博士（阿笠博士） (Agasa Hakase) ……………………绪方贤一
圆谷光彦（円谷 光彦） (Suburaya Mitsuhiko)………………大谷育江
小岛元太（小岛 元太） (Kozima Genta)……………………高木涉
吉田步美（吉田 歩美 ）(Yoshida Ayumi)……………………岩居由希子
高木涉（高木 渉） (Wataru Takagi)…………………………高木涉
佐藤美和子（佐藤 美和子）(Satou Miwako)…………………汤屋敦子
[编辑本段]回顾
柯南历届剧场版
第一部： 1997 引爆摩天楼 (时计じかけの摩天楼)1997/04/23
日文名：时计じかけの摩天楼
英文名：The Timed-Bomb Skyscraper
第二部： 1998 第十四个目标 (14番目の标的)1998/04/15
日文名：14番目の标的
英文名：The Fourteenth Target
第三部： 1999 世纪末的魔术师 (世纪末の魔术师)1999/04/14
日文名：世纪末の魔术师
英文名：The Last Wizard Of The Century
第四部： 2000瞳孔中的暗杀者 (瞳の中の暗杀者)2000/04/12
日文名：瞳の中の暗杀者
英文名：Captured In Her Eyes
第五部： 2001 通往天国的倒计时 (天国へのカウントダウン)2001/04/11
日文名：天国へのカウントダウン
英文名：Count Down to Heaven
第六部： 2002贝克街的亡灵 (ベイカー街の亡霊)2002/04/17
日文名：ベイカー街の亡霊
英文名：The Phantom of Baker Street
第七部： 2003 迷宫的十字路口 (迷宫の十字路)2003/04/19
日文名：迷宫の十字路
英文名：Crossroad in the Ancient Capital
第八部： 2004 银翼的魔术师 (银翼の奇术师)2004/04/17
日文名：银翼の奇术师
英文名：Magician of the Silver Sky
第九部： 2005 水平线上的阴谋 (水平线上の阴谋)2005/04/09
日文名：水平线上の阴谋
英文名：Strategy above the depths
第十部： 2006 侦探们的镇魂歌 (探侦たちの镇魂歌)2006/04/15
日文名：探侦たちの镇魂歌
英文名：The Private Eye's Requiem
又名：侦探们的安魂曲
第十一部：2007 蔚蓝的灵柩/绀碧之棺/深蓝色的海盗旗（绀碧の棺)2007/04/21
日文名：绀碧の棺
英文名：Jolly Roger in the Deep Azure
第十二部：2008 战栗的乐谱（戦栗の楽谱）2008/04/19
日文名:戦栗の楽谱
英文名:Full Score of Fear
又名：战栗的总谱
[编辑本段]解析
随着《战栗的乐谱》DVD出租的开始，大家一定对这部剧场版大作抱有不同的看法，不过当结尾打出第13部剧场版制作决定的时候，大家又会是怎样的心情呢？毕竟“13”这个数字，在西方不是什么太好的数字……
当看着曾经大红色的“名侦探柯南”字样被丢弃在泥浆中，渐渐被覆盖，依稀可见的2个黑色人影投射在那滩泥浆中，同时传来令人听后有种汗毛倒立感觉的画外音，对于熟悉柯南剧情的大家，应该会想到谁要在下一部剧场版里登场了……
一切谜题只能等到12月初公开全新剧场版网站时，才能知晓了。届时，本网站将继续为大家提供精心制作的汉化版网页，尽量及时、准确的为大家揭开这个不详数字后面，即将要发生的故事……在漫画和电视中赤井秀一表面上已经死亡,作为与黑暗组织对决中重要的角色,不知道此次剧场版中会否出现他的身影。
[编辑本段]后记
《名侦探柯南》从1997年上映首部剧场版《引爆摩天楼》以来，到今年为止一共推出了12部作品，《漆黑之追迹者》是系列第13作。每年都定于4月上映的该系列素来以高素质著称，是年度日本动画票房TOP10的常客。
经历了计时器、魔法、摩天楼、海底宝藏、音乐等题材，又拉上了服部、怪盗基德等人气配角做帮手，这次终于还是要再次动用琴酒大哥了莫……虽然被鱼肉的fans们也经常有“剧场版真是一代不如一代”的感叹，进而质疑是否制作方真的是江郎才尽……但是捏，就算再怎么不满，看柯南新剧场版已然成为了动漫饭们的一大习惯，话说有爱才有希望，就让我们怀着一颗期盼之心，拭目以待《漆黑之追迹者》给我们带来这漫长等待下长长的享受……
[编辑本段]主要出场人物
江户川柯南（江戸川 コナン）(Conan Edogawa) 声优：高山南
毛利兰（毛利 兰）（Mouri Ran） 声优：山崎和佳奈 剧照
灰原哀（灰原 哀）(Ai Haibara） 声优：林原惠美
琴酒（琴 酒）（Gin）(GIN ジン) 声优：堀之纪
苦艾酒（Vermouth ベルモット 也有译为贝尔摩得） 声优：小茉 美
毛利小五郎（毛利 小五郎） (Kogoro Mori) 声优：神谷明
佐藤美和子（佐藤 美和子）(Satou Miwako) 声优：汤屋敦子
放映时间
4月17日下午21:30开放
[编辑本段]主题曲
PUZZLE 仓木麻衣
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