流传的《名侦探柯南》大结局十五种
（一）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，与小兰共结连理。后来两人有了爱情的结晶（一个男孩），取名为工藤柯南……
（二）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但小哀在与黑暗组织的决战中为掩护新一不幸被琴酒枪杀。新一与小兰共结连理，后来两人有了爱情的结晶（一个女孩），取名为工藤志保……
（三）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但毛利小五郎在与黑暗组织的决战中壮烈牺牲。新一继承了毛利侦探事务所，与小兰共结连理并改名为毛利新一，后来与小兰有了爱情的结晶（一个女孩），取名为毛利洋子……
（四）小兰知道了柯南的真实身份后恼羞成怒，用空手道修理柯南，结果用力过猛酿成无法挽回的悲剧……
（五）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但在新一向小兰告白前夕，小兰遭遇车祸……
（六）在与黑暗组织的决战中，小兰不幸……，志保和新一远走高飞……
（七）全体被黑暗组织抓住后乱枪扫射……
（八）全体被黑暗组织抓住后捆住手脚丢到海里喂鲨鱼……
（九）柯南在与黑暗组织的决战中和琴酒同归于尽……
（十）打败黑暗组织后，柯南没能变回来，向小兰表白身份后，两人移居美国治疗柯南的侏儒症……
（十一）柯南终于打败黑暗组织并找到恢复身体的方法，但小哀因嫉妒用APTX4869给小兰投毒，并毁掉了解药逃走，新一只好服下最后一颗APTX4869，又变回了柯南……
（十二）柯南终于打败黑暗组织，但却无法再恢复成工藤新一，向小兰说明一切后，两人洒泪分手……几天之后柯南的班上转来一个很可爱的小女孩，柯南看到她时一下子惊呆了（你知道是谁了吧）。女孩微笑着对柯南说：“我会永远和你在一起，你再也赖不掉了！”若干年之后在夏威夷的海滩上出现了一对年轻的情侣……
（十三）知道恢复无望的柯南心灰意冷，在这时却得到了哀的安慰。在哀的默默鼓励下，柯南终于恢复了信心，继续向未知挑战，而两人的感情也就此产生了……
（十四）柯南终于击败了神秘组织，但最终一战中，头部却受到了重伤，并且丧失了全部记忆。由哀处得知事情真相的小兰，却没理由逼迫一个小学生去思索过去的事情。于是，柯南做为一个小学生侦探，与他的伙伴们一起成长着……
第一部分：江户川文代二度现身
江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！
柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。
与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。
而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。
在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！
柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。
但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。
原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。
与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。
而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！
第三部份：小说家的意外访客
赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。
因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。
在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。
工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客——目暮警官。
目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死party，自己还当了他儿子的教父！
他就是曾经扬名世界的伟大魔术家——黑羽先生！
优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。
这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。
得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！
而美国go-vern-ment也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。
当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。
关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是——“Sherry”。
第五部份：接近
画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。
哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。
这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼唤，兰终于爆发奥义，一击之下击倒了号称不败的风间。
Judy正要枪杀哀时，Gin突然出现了，把枪口对准Judy。他命令Judy放下枪，并说哀对组织还有用。Judy奇怪的问：“不是你要我到这里来杀死她的吗？”Gin突然扣动扳机，一张扑克牌打中了Judy的手。原来这个Gin是基德扮成的。基德让哀先去救柯南，自己在这里看着Judy。
哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而这一切都被组织内部的摄像机拍摄到了。
这时优作也已经赶到了东京，越来越多的信息汇集起来，在他的特殊计算机分析下显示出了一个结论。优作看着屏幕目瞪口呆。
第六部份：真相只有一个
Gin和Vodka不知去向，哀顺利的找到了柯南。原来在地下还有组织的列车，两人乘着封闭的列车来到了组织的“圣殿”。
圣殿的正前方是一块巨型液晶墙，上面出现的居然是前首相吉田的脸，他神色狰狞的说出一切。
秘密被完全的解开：基德和他的父亲黑羽之所以以宝石为目标，并不是因为宝石值钱的原因，而是因为其中的一块宝石并非出于地球，而是来自银河系之外！它特殊的物质可以放出特殊的射线，改变细胞的分裂成长方向，从而让细胞获得永恒的生命！
为了在黑暗组织之前找到宝石，黑羽本人假装葬身雪地，让自己的儿子扮演怪盗来寻找宝石。但基德却也一直没能找到它。因为宝石很早就已经落入了黑衣组织之手，也正是在宝石射线的启发下，黑衣组织才开始了“不死药”的计划。
但又因为想要合理的释放出宝石的能量必须解开特殊的方程，需要设计出高级的程序来计算射线的不同状态，组织于是才在世界范围内招募最一流的电脑程序员。
屏幕上吉田所有的话被阿笠博士用无线电传给了外面的毛利等人，大家都非常惊讶。哀说：“不要再躲躲藏藏了，快出来和我们一决胜负吧。”
“恐怕他是不会出来的。”柯南低下头，眼镜闪着银色的光芒说出了令人震惊的话：“因为他早就死了。”
第七部份：人的战斗
柯南完美无暇的推理出了不可思议的结果：吉田首相早在5年前就死去了，杀手正是这个地方的安全保卫系统。也就是说，现在黑衣组织的最高头脑，就是这台具有人工智能的电脑而已，它以利益时间比最大化的程序来发布组织的命令。
屏幕上的吉田哈哈大笑承认自己的身体的确因为心脏病而失去功能，但自己的脑组织结构和DNA数据被完整的保存在的超级计算机中。只要方程能够被解开，自己就能获得重生。这时电脑突然显示射线的方程被解开了，重塑吉田的工程开始。
吉田哈哈大笑，但相关的机器突然爆炸。还是胚胎条件的新的躯体毁灭了。原来是电脑AI自己下了这个命令，并将吉田的所有数据都删除了。AI认为自己完全统治黑衣组织才是最大化的利益。
这时大殿的顶棚突然打开，地面升了起来。柯南发现他们居然到了在停K在东京湾的巨轮甲板上。原来这艘作为黑衣组织大脑的巨轮长期飘荡在太平洋中央，用通讯卫星来操纵世界各地的成员。
站在甲板上迎接他们的是持枪而立的Gin。
Gin向柯南扣动了扳机。
第八部份：江户川柯南VS工藤新一
哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。
柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。
天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。
“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”
“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。
“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”
“哀——”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。
优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。
第九部份：银色弹丸，我们的约定
人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。
工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。
一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。
新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。
“终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。
新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。”
他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。
新一听见步美的声音：
“再见了，柯南同学。”
背景：随着调查的深入，黑暗组织逐渐现形，工藤优作因发现组织 的 >yrL5]iCW
庞大而拜托国际刑警插手。在日本警方及科南的协助下几次阻止了 _ :yB(d 5
其活动，黑暗组织决定报复。 0 6wNV
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黑暗组织偷袭了阿笠博士的家，捉住了少年侦探团，并留下了要工 20W@ <xy
藤新一独自前往营救的暗示。 5}x-i0^z>
在黑暗组织的总部，Gin发现了哀的真实身份并以少年侦探团的生 4HYzj]Iu
命要挟其制作缩小药的解药。早已深思熟虑的哀在一天内制作出解 Ql[dp/
药和假死丸，并巧妙的将胖子的毒药换成假死丸。Gin果然在得到 解 e4bW`;
药后命胖子杀死阿笠及少年侦探团。。。。 `,pU=d[
科南迅速揭开暗示之谜，并赶往黑暗组织的总部，而一切被兰看 Ml13CF
到。在兰的要求下，小五郎和警方对暗示苦思不解，小五郎在睡 梦 ,\ &suQF
中突发灵感而揭开谜题。 :R qjF
在黑暗总部，组织boss大犬出现，其竟是日本内阁大臣。大犬道 &FR %
出黑暗组织的秘密：裕仁天皇临终前留下一份血书，写有黑暗云 云。 X;vrR]V
内阁以为是天皇要建立黑暗组织的遗愿。因而黑暗组织一直得到政
府暗中支持而屹立不倒。而时隔数十年组织仍无法真正揭开血书的
含义。
Gin给哀服下解药后告诉胖子释放哀。对大哥唯命是从的胖子放
了哀，突然Gin被枪击倒。真正的Gin出现并揭穿之前的他是基德
假扮的。
大犬此时说出基德之父其实是组织的特工，从事盗窃工作，而后
来因组织的行动得罪外国而被迫杀其顶罪。
Cris（女教师）道出科南是新一的秘密，交给科南一份血书，要 求
其揭开血书之谜并以缩小药的解药诱惑。科南解开血书之谜，原来
是天皇死前写下的忏悔和对日本未来的担忧。大犬立时呆在当
场。。。。。
兰赶到现场，正碰到Gin要科南留遗言。科南对兰道出真相并表白
后Gin开枪，兰替科南挡下子弹。哀对此震惊不已。。。。。。。
科南终于在紧要关头用麻醉枪射中Gin，而哀与胖子在搏斗中一同 En@ 从楼上跌下。
对药物有强烈抗性的Gin居然转醒，射杀大犬后欲杀科南。而对
coolguy十分欣赏的Cris出手阻拦，两人都受了重伤。
工藤优作，小五郎和目暮等人赶到，小五郎对组织的小喽罗大打 ,
出手，十分英勇。
在众人的围攻下，Gin道出自己的野心和自己身为天皇与美国女
政治家Gino的私生子的秘密后自杀。Cris此时说出自己是美国安插
在组织里的间谍，原来美国也想控制组织。
基德离去之后众人急忙将兰和哀送往医院，并惊讶的发现哀又变
回小孩。
黑暗组织被侦破，而解药只剩下一颗。哀被诊断为脑震荡，醒来
后只记得众人名字而对其他忘的一干二净。兰仍昏迷不醒，大夫说
若长期昏迷可能变植物人。服部建议科南变回新一来唤醒兰，科南
只好如此。而科南变身时被布美看到。
深夜布美来到病房偷吻了新一后离去，并与光彦，元太约定保守
新一的秘密。
兰终于在新一的悉心照料下康复。
由于这件案子，众人都变成名人，兰很不适应。优作则要求新一
及兰一起前往美国读大学。妃回到毛利身边并要兰去美国。而毛利
因英勇表现而被聘回警局当重案组组长，此时毛利道出早已知道
科南是新一而故意不说破的真相。
夕阳中，新一看到哀和少年侦探团开心的玩耍而颇感欣慰。
在机场，众人欢送新一和兰离去，只有哀偷偷转过身去对着自
己和科南的照片垂泪。。。。。。
另一种：（一）
柯南和灰原哀再次躲过了黑衣组织的追杀，两人在阿笠博士家回想着这些天以来的事情。灰原提出，每次黑衣组织都有机会将他们两个人灭口，可是为什么一次次地让他们想尽种种办法逃掉？柯南已经隐隐的感觉到，整个黑衣组织的幕后黑手已经现身，也许就藏在他们的周围。而就在这时，一起持枪抢劫的案件发生在了米花街，而被劫持的正是毛利兰和他的父亲——昏迷不醒的小五郎。
柯南大惊失色，而目暮警官的手下佐藤和高木也来到了阿笠博士的家中。通过现场传达的消息，绑匪的目的不是钱，更不是什么珠宝，而是让柯南和灰原哀前去交换人质，否则毛利父女的性命不保。
人命关天，柯南和灰原带上了博士新发明的道具，前去交换人质。毛利父女安然无恙，小五郎只是被乙醚弄晕了而已。只是柯南和灰原却与绑匪们不知了去向。
一条秘密的通道里，四个人——两个绑匪和柯南、灰原哀穿梭在其中。一道大门打开，光线照射进了柯南的眼中，他惊奇的发现，此处不是别的什么地方，而正是柯南——工藤新一的家。
第一个绑匪解下了面具，是波本——茱蒂老师一再警告柯南的又一个黑衣组织的成员，而另外一个绑匪也解开了面具，居然是工藤新一的母亲——有希子！
（二）
有希子从柯南和灰原的身上拿掉了博士给予他们的道具，阿笠博士和佐藤、高木、目暮警官等人顿时没有了信号而倍感焦急。波本掏出了毛巾，擦掉了脸上的一层皮。工藤新一的父亲——工藤优作帅气的面容展现在了柯南的眼前。
柯南不敢相信眼前的一切，灰原哀更是目瞪口呆。柯南问他的父亲是不是黑衣组织真正的首领，优作默认，而且说明自己化名为“波本”来到了这里，目的就是为了制定这一次的抢劫事件。柯南并不理解这一切到底是怎么回事。有希子拿出了APTX4869的解药，柯南和灰原哀服下后，重新恢复成为了宫野志保和工藤新一的身材和面容。
优作承认自己的所作所为吓到了柯南，但同时他也向柯南说明了自己这样做的目的：其实在17年前，工藤新一还未出生时，有希子的隐退一直是困扰着他的一个谜团，后来根据有希子的情报，她在一次宴会上偷听到说，美国企图运用一切能够达到的方式来控制整个世界，在亚洲首先就是要征服日本，但是这个目标非常的漫长，又非常的棘手。心直口快的有希子在没有惊动别人的情况下告知了优作，优作凭借着种种便利向日本天皇和首相报告了这一信息。首相据此秘密地下了一道命令，为了抵御美国的侵略，要优作和另外几个人一起帮助首相实行一项计划，这个秘密仅仅只有几个人知道：首相本人、工藤优作，另外的两个人是黑羽盗一和目暮十三。
问题补充：（三）
根据协定，首相负责最隐秘的部分，盗一通过自己的神通广大来窃取一切可以的情报，目暮十三进入警局（他已经是警察，所以很方便），工藤优作则通过自己小说家的身份来行动。四方商定，如果有一方事情败露，则必须消失。而黑羽盗一在一次行动中不慎暴露了身份，被迫自杀，而留下了年幼的儿子黑羽快斗。但快斗一直不知道父亲真实的身份，所以并不知情。
这样，经过十多年的时间，美国方面迟迟没有动静，日本本土看似平静，实则隐藏着危机。工藤优作所发展的黑衣组织也已经基本成形。在他的努力下，有几个人决定终身跟随优作，他们就是琴酒、伏特加、贝尔莫特、宫野明美等人。可是在一个晚上，当优作的黑衣组织在进行定时定点联络交易的时候，却被工藤新一逮了个正着。万般无奈之下，琴酒遵循优作的命令，将组织开发出来的毒药APTX4869给新一服下。优作痛心疾首却也无可奈何，所以为了避免组织出大乱子，便派出智商最高的琴酒和力量最大的伏特加予以跟踪新一。
现在网上关于柯南结局的传说都是假的……
保守估计，在现实世界中的APTX4869研制出来之前，73是不会把柯南的结局写完的……
相信大家都听过那个故事：
昨晚我梦到上帝了，他说可以实现我的一个愿望
我拿出一个地球仪，说：“我希望世界永远和平。”
上帝说：“这难度有点大，能不能换一个。”
我想了想：“让我在有生之年看到柯南出结局。”
上帝脸色一下变了：“要不……把地球仪拿来，我再看看……”
1 云霄飞车杀人事件（新一初登场，大家认识一些主要人物）
2 董事长千金绑架事件（1的情节延续）
3 偶像密室杀人事件（冲也洋子初登场）
9 天下一夜祭杀人事件（横沟警部初登场）
10 职业足球选手威胁事件（新一与小兰情感花絮1）
11 月光奏鸣曲杀人事件（tv版首个长篇）
12 步美绑架事件（搞笑的，一场误会）
19 六月新娘杀人事件（原子的初次推理（当然靠柯南的））
27-28 小五郎同学会杀人事件(上)(下)（毛利难得的清醒推理）
32 咖啡店杀人事件（妃英理初登场）
43 江户川柯南诱拐事件（工藤新一父母初登场）
48-49 外交官杀人事件(上)（下）（服部平次初登场，柯南第一次变回新一）
54 电玩公司杀人事件 （黑衣组织重要线索剧情，关于酒名与成员名，需求天才程序员for what？）（感谢SAND推荐）
57-58 福尔摩斯迷杀人事件(上)（下）（服部平次第二次登场，知道柯南身份）
76 柯南对怪盗基德（怪盗基德初登场，强烈推荐）
77-78 名门连续惨死事件(上)（下）（服部平次第三次登场，开始与柯南合作破案）
96 走投无路的名侦探--连续两大杀人事件(新一父母再次出现,柯南差点被小兰识破，群马县山村刑事初登场)
100-101 初恋情人回忆事件(上)(下)（新一与小兰的情感花絮2）
112 帝丹小学7大不可思议事件（搞笑的）
114-115 有氧潜水杀人事件(上)（下）（毛利小五郎与妃英理的情感花絮1）
116-117 推理小说家失踪事件（平次出现的集数）
118 浪花连续杀人事件（远山和叶（服部平次女友）初次登场,和叶父亲出登场）
128 黑衣组织10亿元抢夺事件(灰原哀姐姐香消玉陨)
129 来自黑衣组织的女子（大学教授杀人事件，灰原哀初登场）
130-131 竞技场无差别胁迫事件（新一与组织半个世纪前的联系？）
132-134 魔术爱好者杀人事件（怪盗基德第二次登场）
136-137 青色古城探索事件(上)（下）（步美与灰原就柯南的归属问题双方进行了亲切而友好的交谈）
141-142 结婚前夜的密室事件(上)（下）(柯南与服部再次合作办案)
146-147 本厅刑事的恋爱故事1
153-154 园子的夏日海滩冒险物语(上)（下）（原子认识京极真）
156-157 本厅刑事的恋爱故事2
162 空中的密室&工藤新一首次推理（工藤新一在侦探界粉墨登场，办案中对小兰实施了性引诱）（和286-288工藤新一NY事件相承接）
166-168 鸟取蜘蛛屋的怪物（平次相关案件，也是tv中早期蛮精彩的一次案件）
170－171 黑暗中的死角杀人事件(上)（下）（新一与小兰，毛利与妃英理的情感花絮。案情初看没什么，却为345与黑衣组织直面对决埋下了大伏笔！！！）
174 二十年后的杀机（法律追溯期最早是在这里学到的，非常精彩的一部特别篇！）
176-178 与黑之组织的再会(重大情节进展，跳楼推荐)
180-181 红色的杀机夜想曲(内有少许情感花絮，结尾处)
188～193 命运的复活系列（看tv版如果不看这里的话就白看了，别的不用多说了）
194-195 意味深长的音乐盒（命运复活系列的后续）
199-200 嫌疑犯毛利小五郎（上）（下）（妃英理为毛利首次解围）
205-206 本厅刑事的恋爱故事3
208-209 通往迷宫的入口，巨大神像的愤怒（风光片，完整地看柯南的话，除了能看到主线，八卦，更多的就是各地的风光与名胜）
212-213 蘑菇，熊与侦探队(上)（下）（光彦对灰原有一点点动心）
217-218 目暮警官尘封的秘密(上)（下）(木暮警官的艳史)
219 名侦探的聚会！新一对怪盗基德（7个名侦探聚会）（怪盗基德的过去）
220-221 充满谎言的委托人(上)(下)（服部平次母亲初登场）
222-224 人鱼失踪记（平和感情戏，关键词长生不老，游客花名册上有宫野志保的名字）
226-227 战斗游戏的陷阱(上)(下)（神秘英语老师登场）
228-229 充满杀意的陶艺教室(上)(下)（新一与小兰情感花絮）
230-231 谜一样的乘客(上)(下)（神秘男子登场）
233-234 内有对 谜一样的乘客 最后的一点交代
238-239 大阪的3个K事件（从某种意义上来讲，平次是在填补新一的经常性缺位所导致的遗憾与怨念，干脆柯南结束后再继续连载名侦探新一得了，感觉也挺有市场的）
240-241 新干线护送事件（与上集链接）（这集真是八卦集合，新一与兰，高木和佐藤）
242 元太少年的灾难（推荐直接看最后的重要tip）
253-254 本厅刑事的恋爱故事4（神秘男子二度登场）
258-259 来自芝加哥的男人(上)(下)（神秘男子三度登场，以及来自芝加哥的神秘男子）
263 大阪双重神秘浪花剑士和太阁之城
264-265 法庭的对决 妃VS小五郎(上)（下）（妃英理法庭表现）
266-268 情人节的真相（新一与小兰，原子与京极真的情感花絮）
269-270 犯罪的纪念品(上)（下）（神秘男子相关）
271-272 急忙掩饰的忽略(上)（下）（英语教师相关）
274-275 幽灵公寓的真相（上）(下）（假新出医生的出场集数）
277-278 英语教师VS西部名侦探(上)（下）
284 中华街雨中的似曾相识(上)
285 中华街雨中的似曾相识(下)
286 工藤新一NY事件(事件篇)
287 工藤新一NY事件(推理篇)
288 工藤新一NY事件(解决篇)（神秘男子的一点过去）（承接162 空中的密室&工藤新一首次推理）
291-293 孤岛的公主与龙宫城（服部和叶与柯南小兰）
301-302 恶意和圣者的行进(上)(下)(佐藤与高木的感情戏，为1200万人质埋伏笔)
304 震动的警视厅 1200万人质（佐藤尘封的感情记忆，可在本厅刑事的恋爱故事系列1~4后观赏）
305-306 看不见的嫌疑犯(毛利小五郎难得又一次清醒推理)
307 无声的证据(上)
308 无声的证据(下)（为309-311提供背景资料， 也与54 电玩公司杀人事件相连接）
309 同黑暗组织的接触(交涉篇)
310 同黑暗组织的接触(追迹篇)
311 同黑暗组织的接触(决死篇) (情节重大进展，恐怖的琴酒（金恩）)
312-313 夕阳染红的女儿节人偶(上)(下)（步美的表白）
323－324 服部平次走投无路(上)(下)（服部对和叶的生死告白）
325-327 火焰中的红马 （服部与柯南联合办案，不错的案子)
329-330 金钱买不到的友情(上)（下）（步美与灰原的双边关系达到新的高度）
333-334 相似的公主(上)(下)(妃英理与工藤有希子正面交锋)
335-336 东都显影所的秘密(上)(下) (追踪者步步紧逼)
338-339 四辆保时捷(上)(下)（紧逼者带来的疑惑，各方势力孰善孰恶）
340-341 厕所里隐藏的秘密(前篇)(后篇)（灰原哀的一点点过去）
343-344 便利店的陷阱(前篇)(后篇)（小兰发现了英语老师的一点点秘密）
345 与黑衣组织直面对决（自命运的复活后最重大的情节进展，吐血推荐，把各方神秘势力带给大家的疑惑都一一解答，真是峰回路转。为了更好的欣赏本集，建议观看者之前至少看过中华街雨中的似曾相识工藤新一NY事件，并且知道那些近期出现的各方神秘人物：英语教师、神秘男子）
346-347 寻找屁股上的印记（案件本身不是重点，不过案件中步美的表现给了灰原决心，作为345重大事件的后续，值得观看。）
350-351 被遗忘的手机 （片中柯南想到了对于345末尾贝尔摩德手机邮件地址的问题，为386-387做个铺垫）
356 基德的空中漫步怪盗基德的部分还是值得一看的，虽然和主线是不会有关的
358-359 本厅刑事的恋爱故事5 （这个系列故事算是主线之外最吸引我的八卦故事了）
361-362 帝丹高中的学校怪谈（真新出医生的回归，片中与片末关于主线的一些交待）
371 沉默的航线（前篇）（末段柯南为什么会想到贝尔摩多，本山手机联系的谁？）
374-375 星星和香烟的暗号 （本山的旧友相关案件，貌似被误导了，末尾对贝尔摩多手机按键声有进展）
381-382 谁的推理秀 （难得见服部）
383 甲子园的恶魔 2小时特别篇 （平次和柯南的又一次合作）
385-387 斯特拉迪瓦里小提琴的不xx音
（关于贝尔摩多手机按键声的线索突破，主要在头和尾有涉及）
390-391 本厅刑事恋爱物语6 （推荐把本厅系列连着先一起看，反正也与主线无关，不用担心剧透）
394-396 奇异屋宇的大冒险（案件本身与主线无关，不过刚开始的7min有关，此外还有Kidd，可以看看）
398-400 奇妙一家的委托 + 心存疑惑的兰（由于一次疏忽，引发小兰的大疑惑，柯南身份再次差点被揭穿，可怜又可爱的小兰）
401-402 宝石抢劫犯（关于帮助柯南掩饰身份的后柯南和灰原的对话，以及可怜的被由美利用的高木）
406-408 柯南和平次的推理魔术（推理会精彩一些，此外，感情戏……，发现到后期除了主线就看这个了）
411 神社牌楼的惊人暗号（柯南也是男人啊，kaka）
418 米花町阁楼的房屋（柯南的父母也是一对活宝）
421-422 银杏色的初恋（此情可待成追忆，只是当时已惘然。博士的初恋，很有看头啊）
425 黑暗组织伸出魔爪的瞬间（Cool!!新成员，新进展，呼吸加速，最后对狙很精彩，主线情节，推荐）
426 给兰的情书（感情戏，感情戏，恩）
427-428 充满神秘的上学之路（案情非重点，关键是最后的伏笔，为本堂瑛佑出场做铺垫）
429-430 回不去的二人 （案件非重点，但本堂瑛佑正是第一次出场，在之后的几十集中他都是个让柯南疑惑的人物）
431 本厅刑警的恋爱物语7（从一次联谊引发的是是非非，恶搞爆笑！！）
445 俄罗斯蓝毛的秘密（五郎猫，毛利与英理的感情戏，真是一对欢喜冤家，同期的剧场版也有这只猫）
446—447被封印的西式窗户 （本堂瑛佑相关案件，感觉他一直在观察柯南）
449 本厅刑事的恋爱物语(介于7,8之间) 虚假的婚礼（看来大家都喜欢这一对，最近出现频率很高，柯南的感情戏卖点之一）
453 因缘与友情的试映会（主线无关，星传……，柯南真是紧扣形势，记得早些年还有韩日世界杯的）
462-465 黑衣组织的影子（系列）（主线剧情，案件本身不是重点。但是关于本堂瑛佑的身份越来越清晰了）
469-470 怪盗基德与四幅名画（KID相关案子）
472-473 工藤新一少年时的冒险 (主角迟迟变不大,只好拍点前传满足一下fans,不过这一话看点颇多,年轻时的毛利,妃英理,工藤优作等人,KID的命名之父的出处也在这一话有交待,推荐)
474 妃英理律师之恋(欢喜冤家的戏也看点之一)
479 与服部平次一起的三天 (2小时特别篇)
484-485 黑色照片的去向 (本堂瑛佑身份底细的进一步揭底)
487 本厅刑警的恋爱物语8 (充满误会的一对,全警察局的同事们也真是有够无聊的,难道适龄男警员们全都未婚)
490 服部平次vs工藤新一 滑雪场的推理对决(早说最近流行拍前传,拍完小学的新一,又来拍初中时的新一,不过看看熟悉的角色的不同时期的扮相,也挺有意思的)
491~504 红与黑的碰撞系列 (又一黑衣组织重大剧情，精彩之极，从未有过的长篇幅主线；不剧透了,总之连着看就对了)
505~506 律师妃英理的证词 （毛利和妃英理这对夫妻间的情感关系穿插的案件）
507~508 卡拉OK包房的死角 （本堂瑛佑相关案件，而且在案件中还发生了一个超级搞笑的事情。本次案件是次要，精彩看点颇多，其一是对于红与黑的碰撞系列的一点后续交代，其二甚为重要的一点是本堂瑛佑识破了柯南的身份，知道了他就是工藤新一！！并且交代了从他初登场以来的目的；其三更为重要也更耐人寻味，在红与黑的碰撞中赤井最后被“杀死”，是否真死了还有待考证，不过本堂瑛佑不知道事情，只是告诉了柯南FBI中发生了很悲伤大事情，柯南先是震惊，而后却是露出了一个耐人寻味之极的又让人感觉一切似乎都在掌握之中的笑容！！！！！！）
509~511 红白**与侦探团 、柯南VS双重暗号之谜、推理对决！新一VS冲矢昴
（这三集可真是够囧的，3集2个案子，一个案子正好一集半！！！！！一开始柯南就获得了情报，组织派出了一名收集情报的新成员，代号“波本”；而后在案件的嫌疑人中灰原又感受到了组织成员的气息，最后锁定是冲矢昴。案件解决后，原本是嫌疑人的冲矢昴提出要借住到博士家，而柯南却是不顾灰原反对让他住到了工藤新一的家中，这一点也很耐人寻味。
接下来是纸飞机事件，小兰和园子去柯南的家打扫，和冲矢昴碰面，最后柯南和冲矢昴两人在两地同时开始推理解密，不分上下。案件解决时柯南和小兰的感情也有升华。最引人怀疑的是最后冲矢昴在柯南家里喝着名叫波本的酒……）
515 怪盗基德的瞬间移动魔术 (基德的事件，值得一看)
516—517 风林火山 迷宫的铠甲武士、风林火山 迷宫的铠甲武士（服部平次登场案件，情节扣人心弦，推理也相当精彩。值得一提的是这两集中出现了柯南中一名新的警官大和敢助，很酷哦，还配有一名女警，典型的警视厅恋爱，记住这名警官，以后还有登场）
521—523 杀人犯工藤新一、新一的真相牵动小兰的眼泪、真正想问的事
（也是三集2个案子，服部平次继续出场，在此次案件中柯南变回了新一哦，在第二个案件中更是柯南首次以新一的身份和服部同时出场解决案子哦，当然的最后柯南和小兰的感情又一次经受考验）
524—525 讨厌的蓝色火花 （523集的结尾在524集结束，冲史昂在最后有登场）
528—529 以柔克谜 （妃英里出场的案件，案件本身没什么，不过中间妃英里可是求助了毛利大叔啊，最后搞出了两人当年分居的一个理由）
532—535 初恋的伤痕、呼唤过去的伤痕、新伤痕与吹口哨的男人、旧伤痕与刑警之魂
（4集讲述了2个案子，也不知道tv制作组最近怎么回事，每集的名字都越来越怪了。
讲述的2个案子是相互承接的，引出了松本厅长的过去，和他脸上的伤疤有关哦，最后还把高木和佐藤的感情再度地升华了，终于……最后两人终于吻上了，至此成为柯南中的几对恋人中第一对成功了的）
537—538 怪盗基德VS最强金库 （柯南和怪盗基德再次对决，不过这次的事件是怪盗基德来救鲁邦哦）
542—543 让鱼儿消失的一角岩 （案情本身没什么，不过最后冲史昂登场了，让灰原再一次受惊）
545—546 雾中尖叫的魔女 （和佐藤有关）
547—548 与犯人共度的两天 （这集和主线无关，不过在开头有一段飙车，看着蛮爽的）
551-552 犯人是元太的父亲 （想知道元太的父亲长啥样，看看吧）
557 与危险的二人同行 （前面出现的大和敢助警官在柯南中二度登场，这集纯粹是个搞笑，不过却是为下面几集讲述起因的，不得不看）
558—561 死亡之馆、赤壁 （柯南他们随大和敢助前往案件发生地，案情很精彩，而且也是在柯南300集以后难得的4集一个案件。此外，还有一名新警官登场，哇塞，熟读中国文化。把论语、诸葛亮、空城计等都用上了，作为国人的柯南迷不得不看的一次案件）
最近重温了凑佳苗的成名作《告白》，每次读完都能有新的收获。这个只有短短六章的小说讲述的是女教师森口悠子因为不满法律对未成年人的过度保护，而对杀死自己女儿的两个学生采取独特的复仇方式报复的故事。虽然篇章简短，却涉及到了教育,伦理,法律与人性等方面，引人深思。
第一章“神职者”是以森口老师的视角来描述的，通篇自白的方式可轻易走进她的内心，随着讲述的深入，故事逐渐明晰。森口四岁的孩子爱美被班内的两名学生杀害，而她选择以自己的方式对两位学生施以报复，称自己把HIV病毒的血液注入了两位的牛奶中。之后的五章都是在第一章的基础上展开来写的。第二章“殉教者”是班长美月的自白，描述了此事件发生后班级内的变化。第三章“慈爱者”是凶手之一的直树的姐姐的自白。第四章“求道者”是以直树的角度，描写了胆怯绝望的直树在家中由闭塞到接近疯狂的变化。第五章“信奉者"是站在另一位天才凶手修哉的视角，揭示了他心理的扭曲。最后一章又回到森口悠子的自白，揭开了她真正的报复计划。
《告白》将暴力美学趋于极致，极其清新的表达了一个极端压抑的故事。这个故事如果单纯的叙述出来，或许会觉得有些难以接受，但它给每个冲突、每个动机予以合理的环境和理由，这让它变得与社会、每个人切实相关。或许现实中你还没遇到这样的事情，但是却可以感受到发生也是必然。把里面的每个人都单独拎出来或许会觉得极端到不合理，但是摆放在一起的时候，却又是自然而符合逻辑的。每个人有每个人的幸福、痛苦、喜悦、愤怒，每个人都要独自一人面对真实的并非人前的那个自己，冷暖自知。但并不是每个人都能扮演好两个自己。最终，整个社会都在和表面的那个人维系着密切的关系，却和真正的那个人愈加背离。
《告白》采用个人独白式的叙事手法，把一个事情描画成了多面体，代入感很强，这不是主角一个人的故事，它很细致地刻画了每一个和事实有关的人不同的心理状态，叙事惨烈而不留情面。同一件事，牵涉其中的人或旁观者分别以各自的视角来表达看法，这让我不由想起了黑泽明的《罗生门》。那种用多视角的结构方式表达出人性弱点或丑恶的一面，充分揭示了人与人之间的不可信任性和不可知性。每个人都怀着利己的目的，提供着美化自己、使得所述真相不尽相同的证词。和《罗生门》不同的是，《告白》的每个部分没有任何刻意修饰的成分，每个人的内心告白都是自己的真实想法，也许会对别人或事件产生片面或不完整的解读，但都是从他们的视野中得到的真实印象。因为真实，所以我往往能从某个角色的身上看到自己的影子，从某句自白中读出自己的内心。
我很喜欢美月，穿着那件有铁链装饰的黑色裙子的女孩，她走过去跟那个男孩见面的画面，很动人。青春期的孩子，大多有一些黑暗信仰，而这个女孩子也是，勇敢善良聪明又盲目崇拜，而她敢于站在众人反对的那一边，却莫名其妙地牺牲了自己。他们恋爱的明媚桥段，一下子化为泡影，这从另一个层面，深入解读了男孩变态的心理。
还有直树，那个成绩比较差的男孩，幻想艾滋病得了精神分裂，杀了自己的母亲。
班级学生被教师暗中挑拨利用，群起欺负那两个男孩，沉抑的校园氛围，暗含着人性的黑暗和疯狂。善良被换上了另外的服装躲在角落里细细低语，复仇和变态的狂妄在乌云里慢慢压近教学楼的天台。
而这些，只因为那个教师的不幸经历和男孩的缺失母爱的病态心理。
在人们的常识里，孩子是懵懂而纯洁的。他们的思维以及行为，全部是免检产品。然而，真正认识生命的价值需要漫长的人生体验，认为孩子比成人更纯洁的说法，有些一厢情愿。
如果读过乙一的小说，你会发现，人的欲望并不是随着成长逐渐增加，而是在年幼时就深深根植于人性之中的，并且由于小孩子社会属性的缺失，他们对于欲望的追逐并不存在满足上的延宕，因而他们恶得更纯粹，也更彻底。诗人北岛曾说：“人总是自以为经历的风暴是唯一的风暴，且自喻为风暴，想把下一代也吹得东摇西晃。”
成年人总是自以为是地认为：年轻的一代并未经历过苦难的岁月，因而他们是幸福的，也是无知的。理所当然他们并不具备获得话语权力的资本。贾樟柯曾言，这种对待“苦难”强烈的不平等精神是一种“苦难”霸权。
在本书中，暴力的滥用者以及无辜的受害者都是年轻的中学生。
和成年人相比，他们涉世未深。但是，他们对于人性深渊的罪恶意识却比成年人有着更为深刻和敏锐的洞悉。年长的人们肯定会质疑，他们认为苦难的岁月只会在自己的身上烙下印记，而年轻一代享有的则是由自己开创出来的美好明天。但事实上，人们往往发现，纵使你吃尽苦头，终于迎来人人拍手称好的时代，最后仍会无可奈何地明白这个所谓的“美好”不过只是一个通向地狱的路标。
在青春期里跋涉的盲目狂热反叛迷失自我的少年们，需要正确地被理解和包容，才能健康成长。为了得到好的东西产生的变态不正当的行为；为了报复自己遗失或被抢走了心爱的事物，而变得冷漠无情。而这些，根本性还是因为：爱和美好的事物的缺失。
在《告白》中，女教师对少年犯A说：“如果你生性邪恶，那我又何必提醒自己你还只是个孩子。”大多数孩子的立场观点，是由教师来引导的。所以，这部**是无比冷酷的，那位老师的形象与普遍的教师形象出现了巨大背离，女教师是幕后的指纵者。她意识到惩罚恶人，必须首先不把他当作孩子，要必要用极端的方式使之觉醒，或者付出代价。
“身为人母我恨不得把A和B都杀了，但我也为人师表。告诉警方真相，让凶手得到应有的处罚虽然是成人的义务，但教师也有义务保护学生。”难以想象森口是怎样悲痛又冷静的说出这句话。联系现行过度的未成年人保护法，的确，法律天生难保公平，所谓民主自由的社会和教育是否造成了青少年成长环境的畸变？青少年犯罪的外表下，抽丝剥茧后的犯罪动机竟如此简单，这在造成强大冲击力之余，也促使我们产生更多思考。在这部**里，谁都没有得到救赎。无边界的极端自我下，人们做着冷酷伤害他人的事情，却又不以为然。时时刻刻都践行着平庸而无知的罪恶。
就像《告白》中围绕着森口悠子的缜密计划所进行的报复之路上被剖析的每个人物的内心，每个人物都是丰满立体的，既担负着道义，良知与责任，又都有着阴暗的一面。在直树坦言看到爱美睁眼才把她扔进游泳池带来的震惊之余，修哉埋下的炸弹就像是高涨的青少年犯罪势头，带着犯罪心理及动机的不确定性在故事的结尾轰然爆裂。在直树和修哉先后杀害了自己最亲爱的人之后，痛失爱女的森口悠子用自己的完美复仇计划向学生们诠释了：最好的报复是感同身受，最好的教育是将心比心。
在日本推理小说最纯粹的流派——本格派已经无法依靠其自己的力量支撑推理小说的发展之时，各种变革应运而生，包括对本格推理产生严重动摇的东野圭吾，写着温暖又不失推理风格的伊坂幸太郎，以及文笔细腻清冷的凑佳苗在内，都在传统本格精神下试图寻求突破。然而不管变革方向如何，都有一种东西会始终贯穿其中，那就是曾经的正统作家所忽略，至少说不那么看重的，隐秘、幽微而又扭曲的人性。
看日本**和小说，常常会陷入一种莫名的压抑之中。那种被放大后的人性的丑恶让人不寒而栗。是日本如此还是人性如此？有种说法，日本狭小的国土面积使大多数日本人与生俱来产生一种危机感。平静浮于表面，疯狂压抑深处，危机贯穿血液。你怎能忽视了它？
因此会不自觉陷入一种迷惘的反思状态。思考它的理性与疯狂，对待人性软弱面的严肃，对人性丑恶面夸张的渲染，对人性残忍面无原则的包容。似乎将人性所有复杂之处一并摊开，却又不负责对你感官的冲击你是否能够承受。但是，艺术源自生活，若把艺术当做生活，又不免有些愚蠢。
凡事不必庸人自扰，世界不完美，人性很自私，但还没有那么糟糕。
一点同名**观后感：
导演非常成功的以各种**技法成功的最大程度地影像化了凑佳苗的原著小说，给观众以莫大的视觉冲击力与深远的心理冲击力，显示出非常了不起的导演功力与熟练技法。中岛哲是个很会用镜头说话的人，我印象中最深刻的一点，是**中反复出现的利用反光镜拍摄的模拟回忆的影像，暗示心灵与环境的扭曲，或许还有更深层的意义或者影像美学。此外还有37名平均13岁的学生，在知道同学杀了人后，依然在阳光下嬉戏打闹的场景，让人不寒而栗。
《告白》算不得是一部具有极高摄影艺术的**。对于一个观众来说，由于大多数只有一次观赏某部**的机会，所以，将技巧和艺术高度结合的摄影艺术，往往不太可能被观众所首先感知到。**的故事，人物，最后是情怀，这些基本信息被观众所理解，并形成完整的概念的时候，他们已经走出**院，在回家的路上了。那么，所谓的“摄影”好，对于大多数来说，只不过是“漂亮”而已。稍微专业一点叫形成了相对深刻的映像记忆，仅此而已。
《告白》会给人一种美的享受。慢速剪辑，唯美音乐，画面构图，每一句话、甚至每一滴血都轻柔、安详。在看的时候，仅仅跌宕起伏的故事内容，就能够完全吸引住你，一切的想法在精彩的故事结束之后，才会浮上心头。
我很喜欢这种感觉。
结局还没有,不过有透漏了第一部分：江户川文代二度现身
江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！
柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。
与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。
而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。
在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！
柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。
但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。
原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。
与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。
而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！
第三部份：小说家的意外访客
赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。
因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。
在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。
工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客——目暮警官。
目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死党，自己还当了他儿子的教父！
他就是曾经扬名世界的伟大魔术家——黑羽先生！
优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。
这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。
得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！
而美国政府也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。
当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。
关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是——“Sherry”。
第五部份：接近
画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。
哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。
这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼唤，兰终于爆发奥义，一击之下击倒了号称不败的风间。
Judy正要枪杀哀时，Gin突然出现了，把枪口对准Judy。他命令Judy放下枪，并说哀对组织还有用。Judy奇怪的问：“不是你要我到这里来杀死她的吗？”Gin突然扣动扳机，一张扑克牌打中了Judy的手。原来这个Gin是基德扮成的。基德让哀先去救柯南，自己在这里看着Judy。
哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而这一切都被组织内部的摄像机拍摄到了。
这时优作也已经赶到了东京，越来越多的信息汇集起来，在他的特殊计算机分析下显示出了一个结论。优作看着屏幕目瞪口呆。
第六部份：真相只有一个
Gin和Vodka不知去向，哀顺利的找到了柯南。原来在地下还有组织的列车，两人乘着封闭的列车来到了组织的“圣殿”。
圣殿的正前方是一块巨型液晶墙，上面出现的居然是前首相吉田的脸，他神色狰狞的说出一切。
秘密被完全的解开：基德和他的父亲黑羽之所以以宝石为目标，并不是因为宝石值钱的原因，而是因为其中的一块宝石并非出于地球，而是来自银河系之外！它特殊的物质可以放出特殊的射线，改变细胞的分裂成长方向，从而让细胞获得永恒的生命！
为了在黑暗组织之前找到宝石，黑羽本人假装葬身雪地，让自己的儿子扮演怪盗来寻找宝石。但基德却也一直没能找到它。因为宝石很早就已经落入了黑衣组织之手，也正是在宝石射线的启发下，黑衣组织才开始了“不死药”的计划。
但又因为想要合理的释放出宝石的能量必须解开特殊的方程，需要设计出高级的程序来计算射线的不同状态，组织于是才在世界范围内招募最一流的电脑程序员。
屏幕上吉田所有的话被阿笠博士用无线电传给了外面的毛利等人，大家都非常惊讶。哀说：“不要再躲躲藏藏了，快出来和我们一决胜负吧。”
“恐怕他是不会出来的。”柯南低下头，眼镜闪着银色的光芒说出了令人震惊的话：“因为他早就死了。”
第七部份：人的战斗
柯南完美无暇的推理出了不可思议的结果：吉田首相早在5年前就死去了，杀手正是这个地方的安全保卫系统。也就是说，现在黑衣组织的最高头脑，就是这台具有人工智能的电脑而已，它以利益时间比最大化的程序来发布组织的命令。
屏幕上的吉田哈哈大笑承认自己的身体的确因为心脏病而失去功能，但自己的脑组织结构和DNA数据被完整的保存在的超级计算机中。只要方程能够被解开，自己就能获得重生。这时电脑突然显示射线的方程被解开了，重塑吉田的工程开始。
吉田哈哈大笑，但相关的机器突然爆炸。还是胚胎条件的新的躯体毁灭了。原来是电脑AI自己下了这个命令，并将吉田的所有数据都删除了。AI认为自己完全统治黑衣组织才是最大化的利益。
这时大殿的顶棚突然打开，地面升了起来。柯南发现他们居然到了在停K在东京湾的巨轮甲板上。原来这艘作为黑衣组织大脑的巨轮长期飘荡在太平洋中央，用通讯卫星来操纵世界各地的成员。
站在甲板上迎接他们的是持枪而立的Gin。
Gin向柯南扣动了扳机。
第八部份：江户川柯南VS工藤新一
哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。
柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。
天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。
“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”
“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。
“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”
“哀——”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。
优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。
第九部份：银色弹丸，我们的约定
人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。
工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。
一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。
新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。
“终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。
新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。”
他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。
新一听见步美的声音：
“再见了，柯南同学。”
柯南大结局＿第987集 黑暗组织的秘密
《柯南》第987集 黑暗组织的秘密 （大结局）
内容:
背景：随着调查的深入，黑暗组织逐渐现形，工藤优作因发现组织的
庞大而拜托国际刑警插手。在日本警方及科南的协助下几次阻止了
其活动，黑暗组织决定报复。
黑暗组织偷袭了阿笠博士的家，捉住了少年侦探团，并留下了要工
藤新一独自前往营救的暗示。
在黑暗组织的总部，Gin发现了哀的真实身份并以少年侦探团的生
命要挟其制作缩小药的解药。早已深思熟虑的哀在一天内制作出解
药和假死丸，并巧妙的将胖子的毒药换成假死丸。Gin果然在得到解
药后命胖子杀死阿笠及少年侦探团。。。。
科南迅速揭开暗示之谜，并赶往黑暗组织的总部，而一切被兰看
到。在兰的要求下，小五郎和警方对暗示苦思不解，小五郎在睡梦
中突发灵感而揭开谜题。
在黑暗总部，组织boss大犬出现，其竟是日本内阁大臣。大犬道
出黑暗组织的秘密：裕仁天皇临终前留下一份血书，写有黑暗云云。
内阁以为是天皇要建立黑暗组织的遗愿。因而黑暗组织一直得到政
府暗中支持而屹立不倒。而时隔数十年组织仍无法真正揭开血书的
含义。
Gin给哀服下解药后告诉胖子释放哀。对大哥唯命是从的胖子放
了哀，突然Gin被枪击倒。真正的Gin出现并揭穿之前的他是基德
假扮的。
大犬此时说出基德之父其实是组织的特工，从事盗窃工作，而后
来因组织的行动得罪外国而被迫杀其顶罪。
Cris（女教师）道出科南是新一的秘密，交给科南一份血书，要求
其揭开血书之谜并以缩小药的解药诱惑。科南解开血书之谜，原来
是天皇死前写下的忏悔和对日本未来的担忧。大犬立时呆在当
场。。。。。
兰赶到现场，正碰到Gin要科南留遗言。科南对兰道出真相并表白
后Gin开枪，兰替科南挡下子弹。哀对此震惊不已。。。。。。。
科南终于在紧要关头用麻醉枪射中Gin，而哀与胖子在搏斗中一同
从楼上跌下。
对药物有强烈抗性的Gin居然转醒，射杀大犬后欲杀科南。而对
coolguy十分欣赏的Cris出手阻拦，两人都受了重伤。
工藤优作，小五郎和目暮等人赶到，小五郎对组织的小喽罗大打
出手，十分英勇。
在众人的围攻下，Gin道出自己的野心和自己身为天皇与美国女
政治家Gino的私生子的秘密后自杀。Cris此时说出自己是美国安插
在组织里的间谍，原来美国也想控制组织。
基德离去之后众人急忙将兰和哀送往医院，并惊讶的发现哀又变
回小孩。
黑暗组织被侦破，而解药只剩下一颗。哀被诊断为脑震荡，醒来
后只记得众人名字而对其他忘的一干二净。兰仍昏迷不醒，大夫说
若长期昏迷可能变植物人。服部建议科南变回新一来唤醒兰，科南
只好如此。而科南变身时被布美看到。
深夜布美来到病房偷吻了新一后离去，并与光彦，元太约定保守
新一的秘密。
兰终于在新一的悉心照料下康复。
由于这件案子，众人都变成名人，兰很不适应。优作则要求新一
及兰一起前往美国读大学。妃回到毛利身边并要兰去美国。而毛利
因英勇表现而被聘回警局当重案组组长，此时毛利道出早已知道
科南是新一而故意不说破的真相。
夕阳中，新一看到哀和少年侦探团开心的玩耍而颇感欣慰。
在机场，众人欢送新一和兰离去，只有哀偷偷转过身去对着自
己和科南的照片垂泪。。。。。。
实在忍不住了,告诉你们黑衣人的主谋是谁吧
其实早就已经有太多提示了,你们竟然视而不见你们都被坏人的伪装欺骗了
其实黑衣人的真正首脑,就是一直隐藏在柯南他们身边的---------------------阿立博士DOC,LEE
不明白了吧,其实我一直以为是毛利叔叔的(虽然我很崇拜他)但是那天和柯南赌气,细心分析后我突然发现,原来真正的凶手竟然是憨厚的阿里博士,
可能有人早有怀疑,为什么黑衣组织一直没有找毛利家的麻烦
为什么新一的父母不关心儿子的情况
为什么工滕优作那么有天赋也没发现黑衣组织的下落
为什么阿立的发明很强但是不卖且从来不工作也不缺钱花
为什么他想要什么资料都能够找到
为什么他给新一的设备只有在抓一般蟊贼的时候有用
为什么只要柯南他们和阿立出去野营就会遇到危险
包括灰原哀（以下简称哀）的出现都很可疑,记得吗当时只说哀晕倒在阿笠家门口!
其实事情是这样的,优作原先就怀疑并且侦察黑衣组织以小说家的身份为掩护,秘密调查,发现一些线索后特意搬到黑衣组织首脑啊立家隔壁住,并且从小培养新一开车打枪,和推理能力,并派新一和阿立混熟想借此侦察一些情报,于是新一在不知情的情况下被利用了,当阿立开始怀疑公滕父子的时候,想出一条毒计,他派琴久和沃克跟踪出去约会的小兰和新一,大家都看过第一集,其实交易是幌子,真正的目的是跟踪,要不然难道琴久他们是因为喜欢才去坐过山车的吗在吸引新一注意以后,他们假装交易,阿立扮演的就是那个交易的商人,一切不露痕迹于是新一也就被他们变成了柯南
于是阿立顺理成章的成为了新一的同伴与监护人并且柯难实际上成为了阿立手中的人质,当时新一的父母第一次出现的那集,实际是和阿立谈判的,最终的结果是阿立用柯南要挟他们两个人流放到瑞士
而优作因为不能和新一说明真相,从而让新一感觉受骗,受到伤害,只能同意阿立的要求,不再回到日本,所以你们看优作只有在103集的时候回过日本,还是变装的,就为了不能让阿立发现
明白了吧，为什么阿立认识\\\'哀的父母
其实APTX-4689就是阿立和哀的父母联合开发的,而成功以后哀的父母意外身亡
他留着柯南不死只不过想观察药品还有没有其他副作用但是突然一天,优作和有席子（柯南的妈妈）突然潜回日本,和柯南(103```104集)秘密接触,让他感觉受到了威胁,于是安排一个间谍时刻跟随在柯南身边,那就是哀
哀其实是APTX4689的第一个实验品,本来药的目的是永保青春,没想到竟然适得其反产生副作用,造成了身体变小,而柯南事件发生以后,哀就成了在柯南身边卧底的最好的人选,为什么柯南从来没有被骚扰过就是因为柯南其实一直在黑衣组织最厉害的老大的监视下根本没必要监视
其实警界奇才特别行动人员毛利小五郎也是因为追查阿立才从警界退出的,当时枪击非英里事件只是借口,所以后来目暮说毛利总把他们引向歧途,其实毛利才掌握了案件的真相,只不过目暮不理解罢了!
毛利和优作两个年富力强的超人侦探一直和阿立和黑衣组织周旋,可怜新一和服部这几个小毛孩子什么都不知道,还以为自己是什么明星侦探,真的很可笑
青山 刚昌（柯南的作者）已经给大家提示了,不过因为太为晦涩所以没几个人看出来其实阿笠这两个字,如果拆解成阿竹立用日文反过来拼写是拉丁文里面的,莫里亚蒂（了解福尔摩斯一书的人都应该知道是谁）所以阿立博士其实应该叫莫里亚蒂教授
结局的说法有很多种，我是比较倾向于阿立博士是黑衣组织的最大头目啦，而且小五郎才是最聪明的这种说法。。。
你看看吧，你相信哪种结局呢。。。
现在是没有出的，73大叔还想赚钱
银色子弹的怒吼－赌上侦探之名的决意！（25小时特别版）
内容披露：
第一部分：江户川文代二度现身
江户川文代又一次来到毛利侦探所，说要带柯南去游乐园。柯南以为她又是美希子所扮，便不加怀疑的跟上了文代的车。但在车上柯南却被江户川文代用手枪控制。原来她是黑衣组织的人，柯南的身份已经被组织完全发现了！
柯南在慌张中还是利用麻醉枪射中了伪装成文代的敌人，在车子冲下大桥前逃脱，往阿笠博士家奔去。
与此同时Gin从学校绑架了少年侦探团，并威胁哀交出她研究APTX4869解毒药的数据资料。哀为了救大家把资料给了组织，并被Gin押上了车。
而Gin在开走前却暗中告诉Vodka在他离开之后就杀死少年侦探团的三人。
在Vodka要枪杀少年侦探团时，柯南终于找到了那里救了大家，但Vodka还是逃走了。并说组织在等着工藤新一。
第二部份：沉睡的小五郎－觉醒！
柯南来到博士家用追踪眼镜找到了哀的下落。柯南留下了一张写明一切的磁盘让博士转交给兰，决定自己去面对黑色组织。
但磁盘被闯入博士家的英语老师Judy拿走了，原来她是黑衣组织上层安排在FBI的特工。阿笠博士用自己的新发明弹射坐椅欺骗了Judy，逃过一死来到了毛利家。当阿笠博士正想告诉小五郎和兰现在的状况时，却发现坐在侦探所客厅里的毛利呈现出沉睡的小五郎的姿势！而毛利面前的笔记本上写着“工藤新一”“柯南”“黑衣组织”等等。
原来毛利早就怀疑了柯南，每次都配合扮演沉睡的角色就是为了调查出柯南的真实身份和整个事件。毛利在沉睡般的深思中展现出他真正的实力，通过柯南留下的磁盘资料推理出了黑衣组织的所在。
与此同时，FBI特工赤井秀一来到同事Judy家，意外的发现了的柯南的磁盘。他偷偷的把磁盘取回了家。秀一解开密码后阅读了柯南的自述以及对整个事件的推理。他对同事Judy的身份开始怀疑，但却突然被人从后面击昏。
而这时在米花町，放学回家的兰在门口意外的听见了小五郎和阿笠博士的对话，终于确定了柯南就是新一！兰在泪水中决意要以性命为赌注，为救回新一与黑衣组织绝一死战！
第三部份：小说家的意外访客
赤井秀一被Judy带回了组织。Gin威胁秀一加入组织，最后的考虑时间为2小时。
因为有了哀的数据和配合。两小时之后，组织的药物数据计算终于就可以完成。也就是传说中的“同时成为上帝和魔鬼。让时间倒转，死人复活”药物的完成。
在世界的另一边，工藤优作和美希子也收到了博士的消息。优作第一次让美希子进入了他的密室，原来这里就是工藤优作独自对抗黑衣组织的总部。而小说家不过是个用来收集资料的幌子。
工藤优作和美希子明白决战的时刻已经来临。收拾装备之时，前门突然出现了意外的访客--目暮警官。
目暮警官撕下自己脸上的伪装。优作惊讶的发现到来的客人居然是自己从学生时代便结交的死党，自己还当了他儿子的教父！
他就是曾经扬名世界的伟大魔术家--黑羽先生！
优作看见10年前已经被判定为失踪的老朋友非常吃惊。而黑羽开门见山的告诉优作，自己这十年也一直在独自对着抗黑衣组织。方式就是让自己的儿子黑羽快斗在世界范围内寻找一块特殊的宝石。而就在今天快斗却给他发来了代表最后决战的消息：关于宝石、新一、黑色组织以及人类的未来。他这才以黑羽的身份重新回到人间！而他的儿子也被人称为平成的亚森罗宾。优作这才恍然大悟，原来自己的教子就是怪盗基德！
第四部份：最黑的黑色
柯南在傍晚来到了东京塔下，东京世界博览会正在这里召开。原来黑衣组织的本部就是东京的中心！柯南骗过了警卫进入了地下室的暗门。
这里是另外一个地下王国。柯南利用阿笠博士交给他的电脑在警卫房间里侵入了黑衣组织的电脑中枢，正在向外传播加密数据时，柯南意外的被人从后面击昏，那个人居然又是Gin。
得到部份数据的阿笠博士将大家所拥有的信息整理到了一起，由优作和小五郎一起推理出了惊天的结论：黑衣组织的老板可能就是日本前首相吉田元博，而天皇本人也是黑衣组织的的支持者！组织的一部分重要功能就是以非法手段达到日本的扩张！
而美国政府也早有察觉了这一点，并且指使FBI特工暗中介入。事实上美国也想通过操作组织来控制日本。
当分析出这一结论之时，毛利租来的车子已经开到了东京塔下。
关押赤井秀一的房门突然打开，走进来的是--“Sherry”。
第五部份：接近
画面在赤井秀一的回忆中展开。他居然是宫野志保的童年最珍贵的伙伴，是唯一愿意和宫野志保玩的孩子。也正是因为这样，赤井秀一才在第一眼就解开了哀身份的迷题。
哀并不承认自己的身份，她说可以放走秀一，条件是要他永远不要再回到这里。两个人在争吵的时候Judy出现了，秀一为救哀而死，留下遗言：“无论在那个世界，你叫什么名字，我都能找到我的天使。”Judy黑色的枪口指向了哀。
这时毛利小五郎也闯入了组织内部，在组织训练杀手的道场用空手道打败了一群职业杀手。就在他洋洋得意之时，总教练出现了，居然是日本空手道冠军风间仁。小五郎被打败了，但跟踪而至的兰却跳了出来，兰在被风间的实力打入绝望之时耳边传来新一的呼唤，兰终于爆发奥义，一击之下击倒了号称不败的风间。
Judy正要枪杀哀时，Gin突然出现了，把枪口对准Judy。他命令Judy放下枪，并说哀对组织还有用。Judy奇怪的问：“不是你要我到这里来杀死她的吗？”Gin突然扣动扳机，一张扑克牌打中了Judy的手。原来这个Gin是基德扮成的。基德让哀先去救柯南，自己在这里看着Judy。
哀跌跌撞撞的跑向控制牢房，而这一切都被组织内部的摄像机拍摄到了。
这时优作也已经赶到了东京，越来越多的信息汇集起来，在他的特殊计算机分析下显示出了一个结论。优作看着屏幕目瞪口呆。
第六部份：真相只有一个
Gin和Vodka不知去向，哀顺利的找到了柯南。原来在地下还有组织的列车，两人乘着封闭的列车来到了组织的“圣殿”。
圣殿的正前方是一块巨型液晶墙，上面出现的居然是前首相吉田的脸，他神色狰狞的说出一切。
秘密被完全的解开：基德和他的父亲黑羽之所以以宝石为目标，并不是因为宝石值钱的原因，而是因为其中的一块宝石并非出于地球，而是来自银河系之外！它特殊的物质可以放出特殊的射线，改变细胞的分裂成长方向，从而让细胞获得永恒的生命！
为了在黑暗组织之前找到宝石，黑羽本人假装葬身雪地，让自己的儿子扮演怪盗来寻找宝石。但基德却也一直没能找到它。因为宝石很早就已经落入了黑衣组织之手，也正是在宝石射线的启发下，黑衣组织才开始了“不死药”的计划。
但又因为想要合理的释放出宝石的能量必须解开特殊的方程，需要设计出高级的程序来计算射线的不同状态，组织于是才在世界范围内招募最一流的电脑程序员。
屏幕上吉田所有的话被阿笠博士用无线电传给了外面的毛利等人，大家都非常惊讶。哀说：“不要再躲躲藏藏了，快出来和我们一决胜负吧。”
“恐怕他是不会出来的。”柯南低下头，眼镜闪着银色的光芒说出了令人震惊的话：“因为他早就死了。”
第七部份：人的战斗
柯南完美无暇的推理出了不可思议的结果：吉田首相早在5年前就死去了，杀手正是这个地方的安全保卫系统。也就是说，现在黑衣组织的最高头脑，就是这台具有人工智能的电脑而已，它以利益时间比最大化的程序来发布组织的命令。
屏幕上的吉田哈哈大笑承认自己的身体的确因为心脏病而失去功能，但自己的脑组织结构和DNA数据被完整的保存在的超级计算机中。只要方程能够被解开，自己就能获得重生。这时电脑突然显示射线的方程被解开了，重塑吉田的工程开始。
吉田哈哈大笑，但相关的机器突然爆炸。还是胚胎条件的新的躯体毁灭了。原来是电脑AI自己下了这个命令，并将吉田的所有数据都删除了。AI认为自己完全统治黑衣组织才是最大化的利益。
这时大殿的顶棚突然打开，地面升了起来。柯南发现他们居然到了在停K在东京湾的巨轮甲板上。原来这艘作为黑衣组织大脑的巨轮长期飘荡在太平洋中央，用通讯卫星来操纵世界各地的成员。
站在甲板上迎接他们的是持枪而立的Gin。
Gin向柯南扣动了扳机。
第八部份：江户川柯南VS工藤新一
哀挡住了射向柯南的子弹，倒在柯南的面前，Gin步步逼近。巨轮的自动排外系统启动。目标是一切生命体，Gin被桅杆的狙击枪射中，一发又一发直到确认心脏停止。
柯南死死的挡在哀的身上，万幸的是他们的因为目标过小不予判定。
天空渐渐就要亮了，哀微笑着拿出粘血的药丸，世界上唯一的一颗APTX4869解药。
“柯南，好想永远和你在一起。但我们没有机会了吧。”哀握着解药的手伸向柯南的脸：“吃下去吧。”
“笨蛋！这颗解药只要得救之后分析成分就能复制了啊！”柯南抱紧了哀。
“不要。”哀突然大声的咳嗽起来，在一瞬间把药塞进柯南的嘴里。“你还不明白吗？”哀看着柯南意外的吞下药丸，缓缓露出笑脸：“这是科学和推理无法解释的问题呢！”哀在闭上眼睛的时候用只有柯南听得见的声音说：“不是工藤新一。我爱的人，是江户川柯南。”
“哀--”药物和心意一起让柯南感觉无比疼痛，他昏了过去。
优作和小五郎在突然之间灵光一闪。优作终于找到了破解这个由科学与逻辑组成的巨大机器的银色子弹。第九部份：银色弹丸，我们的约定
人类击溃一切邪恶与魔鬼的银色弹丸就是无可代替的“爱”。“爱”就是科学与逻辑永远无法解释的程序。
工藤优作发送的银色弹丸在以瞬间传导到了电脑中枢。超级计算机由于溢出的计算以及以及无法模拟程序方式而最终崩溃。巨轮倒数五分钟的自爆装置开始启动。新一在迷迷糊糊中听见了熟悉的呼唤：“新一！新一！”还有直升机的声音。
一切都结束了：巨轮在太阳升起的时候爆炸了。
新一坐在了海边见那种比太阳还要耀眼的光芒，暗想：“江户川柯南已经不存在在这个世界了。他已经和哀一起去了属于他们的幸福花园。而我……”他转过头看见立在身后泪水莹莹的兰。
“终于实现了，我们的约定！”新一把兰紧紧的抱在怀里，很久很久。
新一突然看见站在远处朝霞里的少年侦探团，他习惯性的想跑过去和大家一起，但脚步又突然停住。新一缓缓的转过身去，用只有自己能听见的声音说：“大家，再见了。”
他慢慢的往另一边的人群中走去，没有回头，咬紧牙齿泪水居然都忍不住模糊了眼睛。一颗很大的泪珠突然滑落，之后更多的泪水紧随其后落下。
新一听见步美的声音：
“再见了，柯南同学。”
唐人新网：仅供轻松一笑，切误当真！
作者：同人可能性比较大！
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