两人是同学平常关系不错，男孩有些残疾向女孩表白被拒绝了，过后关系依然还和以前一样，现在女孩有男朋友

原因可能是：
1、女孩是自信的。
2、女孩对男孩只有友谊，并没有感情方面的想法，但她不愿意失去这份友谊。
3、女孩拒绝男孩，有很大可能是因为男孩的残疾，而不是性格人品，内心隐隐有些不忍。在某些方面给予男孩一些抚慰，以减轻内心的愧疚和不安。
4、有一个对自己有好感的异性呵护或仰慕，这是众多女孩所骄傲的。
建议：
若是能放下感情，只留下友谊，适当联系倒无妨，但是仍然要把握一个度，不能影响对方的感情生活。
若是还放不下，则不要去联系或者少联系。